Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTU7

CBLN4, Cerebellin-4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN4Q9NTU7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CBLN4Q9NTU7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CBLN4Q9NTU7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CBLN4Q9NTU7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CBLN4Q9NTU7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CBLN4Q9NTU7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CBLN4Q9NTU7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CBLN4Q9NTU7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CBLN4Q9NTU7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CBLN4Q9NTU7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CBLN4Q9NTU7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CBLN4Q9NTU7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CBLN4Q9NTU7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CBLN4Q9NTU7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CBLN4Q9NTU7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CBLN4Q9NTU7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CBLN4Q9NTU7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CBLN4Q9NTU7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CBLN4Q9NTU7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CBLN4Q9NTU7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CBLN4Q9NTU7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CBLN4Q9NTU7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CBLN4Q9NTU7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CBLN4Q9NTU7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CBLN4Q9NTU7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CBLN4Q9NTU7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CBLN4Q9NTU7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CBLN4Q9NTU7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CBLN4Q9NTU7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CBLN4Q9NTU7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CBLN4Q9NTU7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CBLN4Q9NTU7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CBLN4Q9NTU7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CBLN4Q9NTU7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CBLN4Q9NTU7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CBLN4Q9NTU7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CBLN4Q9NTU7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CBLN4Q9NTU7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBLN4Q9NTU7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CBLN4Q9NTU7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBLN4Q9NTU7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CBLN4Q9NTU7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CBLN4Q9NTU7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CBLN4Q9NTU7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CBLN4Q9NTU7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CBLN4Q9NTU7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CBLN4Q9NTU7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CBLN4Q9NTU7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CBLN4Q9NTU7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CBLN4Q9NTU7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CBLN4Q9NTU7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CBLN4Q9NTU7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBLN4Q9NTU7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBLN4Q9NTU7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CBLN4Q9NTU7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBLN4Q9NTU7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CBLN4Q9NTU7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBLN4Q9NTU7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBLN4Q9NTU7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBLN4Q9NTU7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CBLN4Q9NTU7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBLN4Q9NTU7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBLN4Q9NTU7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBLN4Q9NTU7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBLN4Q9NTU7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CBLN4Q9NTU7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CBLN4Q9NTU7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBLN4Q9NTU7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBLN4Q9NTU7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBLN4Q9NTU7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBLN4Q9NTU7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBLN4Q9NTU7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBLN4Q9NTU7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBLN4Q9NTU7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBLN4Q9NTU7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBLN4Q9NTU7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBLN4Q9NTU7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBLN4Q9NTU7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBLN4Q9NTU7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBLN4Q9NTU7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBLN4Q9NTU7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBLN4Q9NTU7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBLN4Q9NTU7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBLN4Q9NTU7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBLN4Q9NTU7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBLN4Q9NTU7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBLN4Q9NTU7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBLN4Q9NTU7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBLN4Q9NTU7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBLN4Q9NTU7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBLN4Q9NTU7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBLN4Q9NTU7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBLN4Q9NTU7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBLN4Q9NTU7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CBLN4Q9NTU7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CBLN4Q9NTU7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBLN4Q9NTU7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBLN4Q9NTU7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBLN4Q9NTU7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBLN4Q9NTU7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms