Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPMQ9NSP4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPMQ9NSP4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPMQ9NSP4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPMQ9NSP4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPMQ9NSP4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPMQ9NSP4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPMQ9NSP4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPMQ9NSP4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPMQ9NSP4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPMQ9NSP4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPMQ9NSP4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPMQ9NSP4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPMQ9NSP4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPMQ9NSP4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CENPMQ9NSP4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPMQ9NSP4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPMQ9NSP4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPMQ9NSP4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPMQ9NSP4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPMQ9NSP4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPMQ9NSP4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPMQ9NSP4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPMQ9NSP4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CENPMQ9NSP4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPMQ9NSP4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPMQ9NSP4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPMQ9NSP4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPMQ9NSP4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPMQ9NSP4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPMQ9NSP4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPMQ9NSP4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPMQ9NSP4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPMQ9NSP4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPMQ9NSP4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPMQ9NSP4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPMQ9NSP4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPMQ9NSP4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPMQ9NSP4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPMQ9NSP4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPMQ9NSP4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPMQ9NSP4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPMQ9NSP4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPMQ9NSP4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPMQ9NSP4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPMQ9NSP4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPMQ9NSP4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPMQ9NSP4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPMQ9NSP4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPMQ9NSP4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPMQ9NSP4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CENPMQ9NSP4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPMQ9NSP4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPMQ9NSP4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPMQ9NSP4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPMQ9NSP4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPMQ9NSP4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPMQ9NSP4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPMQ9NSP4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPMQ9NSP4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPMQ9NSP4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPMQ9NSP4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPMQ9NSP4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPMQ9NSP4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPMQ9NSP4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPMQ9NSP4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPMQ9NSP4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPMQ9NSP4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPMQ9NSP4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPMQ9NSP4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPMQ9NSP4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPMQ9NSP4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPMQ9NSP4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPMQ9NSP4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPMQ9NSP4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPMQ9NSP4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPMQ9NSP4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPMQ9NSP4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPMQ9NSP4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPMQ9NSP4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPMQ9NSP4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPMQ9NSP4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPMQ9NSP4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPMQ9NSP4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPMQ9NSP4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPMQ9NSP4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPMQ9NSP4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPMQ9NSP4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPMQ9NSP4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPMQ9NSP4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPMQ9NSP4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPMQ9NSP4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPMQ9NSP4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CENPMQ9NSP4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPMQ9NSP4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPMQ9NSP4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPMQ9NSP4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPMQ9NSP4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPMQ9NSP4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPMQ9NSP4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms