Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SALL1Q9NSC2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SALL1Q9NSC2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SALL1Q9NSC2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SALL1Q9NSC2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SALL1Q9NSC2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
SALL1Q9NSC2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SALL1Q9NSC2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SALL1Q9NSC2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SALL1Q9NSC2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SALL1Q9NSC2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SALL1Q9NSC2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SALL1Q9NSC2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SALL1Q9NSC2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SALL1Q9NSC2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SALL1Q9NSC2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SALL1Q9NSC2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SALL1Q9NSC2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
SALL1Q9NSC2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SALL1Q9NSC2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SALL1Q9NSC2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33■■■□□ 2.87
SALL1Q9NSC2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SALL1Q9NSC2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SALL1Q9NSC2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SALL1Q9NSC2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SALL1Q9NSC2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SALL1Q9NSC2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SALL1Q9NSC2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SALL1Q9NSC2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SALL1Q9NSC2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SALL1Q9NSC2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SALL1Q9NSC2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SALL1Q9NSC2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SALL1Q9NSC2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SALL1Q9NSC2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SALL1Q9NSC2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SALL1Q9NSC2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SALL1Q9NSC2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SALL1Q9NSC2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SALL1Q9NSC2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SALL1Q9NSC2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SALL1Q9NSC2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SALL1Q9NSC2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SALL1Q9NSC2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SALL1Q9NSC2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SALL1Q9NSC2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SALL1Q9NSC2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
SALL1Q9NSC2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SALL1Q9NSC2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SALL1Q9NSC2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SALL1Q9NSC2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SALL1Q9NSC2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SALL1Q9NSC2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SALL1Q9NSC2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SALL1Q9NSC2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SALL1Q9NSC2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SALL1Q9NSC2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SALL1Q9NSC2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SALL1Q9NSC2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SALL1Q9NSC2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SALL1Q9NSC2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SALL1Q9NSC2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SALL1Q9NSC2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SALL1Q9NSC2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SALL1Q9NSC2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SALL1Q9NSC2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SALL1Q9NSC2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SALL1Q9NSC2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SALL1Q9NSC2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SALL1Q9NSC2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SALL1Q9NSC2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SALL1Q9NSC2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SALL1Q9NSC2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SALL1Q9NSC2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SALL1Q9NSC2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
SALL1Q9NSC2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SALL1Q9NSC2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SALL1Q9NSC2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SALL1Q9NSC2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SALL1Q9NSC2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SALL1Q9NSC2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SALL1Q9NSC2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SALL1Q9NSC2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SALL1Q9NSC2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SALL1Q9NSC2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SALL1Q9NSC2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SALL1Q9NSC2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SALL1Q9NSC2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SALL1Q9NSC2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
SALL1Q9NSC2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SALL1Q9NSC2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SALL1Q9NSC2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SALL1Q9NSC2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.81
SALL1Q9NSC2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SALL1Q9NSC2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SALL1Q9NSC2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SALL1Q9NSC2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SALL1Q9NSC2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SALL1Q9NSC2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SALL1Q9NSC2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms