Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
TULP4Q9NRJ4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TULP4Q9NRJ4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
TULP4Q9NRJ4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
TULP4Q9NRJ4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
TULP4Q9NRJ4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
TULP4Q9NRJ4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
TULP4Q9NRJ4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
TULP4Q9NRJ4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TULP4Q9NRJ4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TULP4Q9NRJ4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
TULP4Q9NRJ4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TULP4Q9NRJ4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TULP4Q9NRJ4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
TULP4Q9NRJ4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
TULP4Q9NRJ4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.7
TULP4Q9NRJ4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TULP4Q9NRJ4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TULP4Q9NRJ4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TULP4Q9NRJ4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TULP4Q9NRJ4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TULP4Q9NRJ4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
TULP4Q9NRJ4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
TULP4Q9NRJ4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
TULP4Q9NRJ4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TULP4Q9NRJ4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
TULP4Q9NRJ4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
TULP4Q9NRJ4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
TULP4Q9NRJ4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
TULP4Q9NRJ4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
TULP4Q9NRJ4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
TULP4Q9NRJ4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
TULP4Q9NRJ4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TULP4Q9NRJ4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
TULP4Q9NRJ4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TULP4Q9NRJ4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
TULP4Q9NRJ4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
TULP4Q9NRJ4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
TULP4Q9NRJ4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TULP4Q9NRJ4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
TULP4Q9NRJ4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
TULP4Q9NRJ4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
TULP4Q9NRJ4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
TULP4Q9NRJ4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TULP4Q9NRJ4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TULP4Q9NRJ4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TULP4Q9NRJ4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TULP4Q9NRJ4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TULP4Q9NRJ4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TULP4Q9NRJ4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TULP4Q9NRJ4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TULP4Q9NRJ4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TULP4Q9NRJ4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TULP4Q9NRJ4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TULP4Q9NRJ4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TULP4Q9NRJ4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TULP4Q9NRJ4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TULP4Q9NRJ4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TULP4Q9NRJ4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
TULP4Q9NRJ4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
TULP4Q9NRJ4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC37.9■■■■□ 3.66
TULP4Q9NRJ4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
TULP4Q9NRJ4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TULP4Q9NRJ4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TULP4Q9NRJ4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TULP4Q9NRJ4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TULP4Q9NRJ4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TULP4Q9NRJ4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TULP4Q9NRJ4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TULP4Q9NRJ4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TULP4Q9NRJ4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TULP4Q9NRJ4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TULP4Q9NRJ4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
TULP4Q9NRJ4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
TULP4Q9NRJ4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC37.82■■■■□ 3.64
TULP4Q9NRJ4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TULP4Q9NRJ4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TULP4Q9NRJ4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TULP4Q9NRJ4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TULP4Q9NRJ4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TULP4Q9NRJ4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TULP4Q9NRJ4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TULP4Q9NRJ4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TULP4Q9NRJ4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TULP4Q9NRJ4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TULP4Q9NRJ4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TULP4Q9NRJ4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TULP4Q9NRJ4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TULP4Q9NRJ4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
TULP4Q9NRJ4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
TULP4Q9NRJ4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TULP4Q9NRJ4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TULP4Q9NRJ4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
TULP4Q9NRJ4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
TULP4Q9NRJ4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TULP4Q9NRJ4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TULP4Q9NRJ4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TULP4Q9NRJ4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TULP4Q9NRJ4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TULP4Q9NRJ4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms