Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRH2

SNRK, SNF-related serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRKQ9NRH2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SNRKQ9NRH2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SNRKQ9NRH2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SNRKQ9NRH2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SNRKQ9NRH2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SNRKQ9NRH2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SNRKQ9NRH2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SNRKQ9NRH2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SNRKQ9NRH2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SNRKQ9NRH2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SNRKQ9NRH2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SNRKQ9NRH2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SNRKQ9NRH2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
SNRKQ9NRH2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SNRKQ9NRH2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SNRKQ9NRH2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SNRKQ9NRH2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SNRKQ9NRH2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SNRKQ9NRH2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SNRKQ9NRH2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SNRKQ9NRH2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SNRKQ9NRH2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SNRKQ9NRH2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SNRKQ9NRH2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SNRKQ9NRH2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
SNRKQ9NRH2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SNRKQ9NRH2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SNRKQ9NRH2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SNRKQ9NRH2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SNRKQ9NRH2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SNRKQ9NRH2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SNRKQ9NRH2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SNRKQ9NRH2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SNRKQ9NRH2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SNRKQ9NRH2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SNRKQ9NRH2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SNRKQ9NRH2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SNRKQ9NRH2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SNRKQ9NRH2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SNRKQ9NRH2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SNRKQ9NRH2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SNRKQ9NRH2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SNRKQ9NRH2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SNRKQ9NRH2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SNRKQ9NRH2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SNRKQ9NRH2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SNRKQ9NRH2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
SNRKQ9NRH2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SNRKQ9NRH2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SNRKQ9NRH2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SNRKQ9NRH2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SNRKQ9NRH2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SNRKQ9NRH2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SNRKQ9NRH2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SNRKQ9NRH2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SNRKQ9NRH2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SNRKQ9NRH2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SNRKQ9NRH2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SNRKQ9NRH2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SNRKQ9NRH2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SNRKQ9NRH2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SNRKQ9NRH2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SNRKQ9NRH2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SNRKQ9NRH2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SNRKQ9NRH2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SNRKQ9NRH2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
SNRKQ9NRH2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SNRKQ9NRH2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SNRKQ9NRH2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SNRKQ9NRH2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SNRKQ9NRH2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SNRKQ9NRH2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
SNRKQ9NRH2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SNRKQ9NRH2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SNRKQ9NRH2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SNRKQ9NRH2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SNRKQ9NRH2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SNRKQ9NRH2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SNRKQ9NRH2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SNRKQ9NRH2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SNRKQ9NRH2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SNRKQ9NRH2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SNRKQ9NRH2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SNRKQ9NRH2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms