Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM8Q9NQV8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRDM8Q9NQV8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRDM8Q9NQV8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRDM8Q9NQV8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM8Q9NQV8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM8Q9NQV8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM8Q9NQV8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM8Q9NQV8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM8Q9NQV8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM8Q9NQV8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM8Q9NQV8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM8Q9NQV8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRDM8Q9NQV8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM8Q9NQV8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM8Q9NQV8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM8Q9NQV8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM8Q9NQV8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRDM8Q9NQV8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PRDM8Q9NQV8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM8Q9NQV8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM8Q9NQV8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM8Q9NQV8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM8Q9NQV8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM8Q9NQV8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM8Q9NQV8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM8Q9NQV8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM8Q9NQV8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM8Q9NQV8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM8Q9NQV8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM8Q9NQV8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM8Q9NQV8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM8Q9NQV8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM8Q9NQV8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM8Q9NQV8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM8Q9NQV8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM8Q9NQV8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM8Q9NQV8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM8Q9NQV8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM8Q9NQV8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM8Q9NQV8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM8Q9NQV8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM8Q9NQV8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM8Q9NQV8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM8Q9NQV8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM8Q9NQV8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM8Q9NQV8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM8Q9NQV8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM8Q9NQV8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM8Q9NQV8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM8Q9NQV8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM8Q9NQV8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM8Q9NQV8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM8Q9NQV8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM8Q9NQV8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM8Q9NQV8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM8Q9NQV8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM8Q9NQV8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM8Q9NQV8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM8Q9NQV8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRDM8Q9NQV8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRDM8Q9NQV8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRDM8Q9NQV8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PRDM8Q9NQV8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PRDM8Q9NQV8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PRDM8Q9NQV8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM8Q9NQV8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM8Q9NQV8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM8Q9NQV8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRDM8Q9NQV8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRDM8Q9NQV8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRDM8Q9NQV8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM8Q9NQV8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM8Q9NQV8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM8Q9NQV8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRDM8Q9NQV8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM8Q9NQV8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRDM8Q9NQV8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRDM8Q9NQV8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM8Q9NQV8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM8Q9NQV8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM8Q9NQV8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRDM8Q9NQV8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM8Q9NQV8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM8Q9NQV8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM8Q9NQV8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRDM8Q9NQV8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM8Q9NQV8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM8Q9NQV8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM8Q9NQV8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM8Q9NQV8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM8Q9NQV8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM8Q9NQV8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM8Q9NQV8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM8Q9NQV8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM8Q9NQV8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM8Q9NQV8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRDM8Q9NQV8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM8Q9NQV8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRDM8Q9NQV8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms