Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYLDQ9NQC7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYLDQ9NQC7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYLDQ9NQC7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYLDQ9NQC7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYLDQ9NQC7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYLDQ9NQC7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CYLDQ9NQC7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYLDQ9NQC7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYLDQ9NQC7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYLDQ9NQC7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYLDQ9NQC7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYLDQ9NQC7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYLDQ9NQC7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYLDQ9NQC7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYLDQ9NQC7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CYLDQ9NQC7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYLDQ9NQC7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYLDQ9NQC7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYLDQ9NQC7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYLDQ9NQC7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYLDQ9NQC7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYLDQ9NQC7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CYLDQ9NQC7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYLDQ9NQC7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYLDQ9NQC7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYLDQ9NQC7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYLDQ9NQC7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CYLDQ9NQC7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYLDQ9NQC7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYLDQ9NQC7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYLDQ9NQC7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CYLDQ9NQC7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CYLDQ9NQC7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CYLDQ9NQC7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CYLDQ9NQC7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CYLDQ9NQC7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CYLDQ9NQC7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYLDQ9NQC7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYLDQ9NQC7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYLDQ9NQC7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYLDQ9NQC7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYLDQ9NQC7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYLDQ9NQC7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYLDQ9NQC7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYLDQ9NQC7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYLDQ9NQC7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYLDQ9NQC7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYLDQ9NQC7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYLDQ9NQC7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYLDQ9NQC7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYLDQ9NQC7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYLDQ9NQC7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYLDQ9NQC7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYLDQ9NQC7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CYLDQ9NQC7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYLDQ9NQC7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYLDQ9NQC7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYLDQ9NQC7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYLDQ9NQC7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYLDQ9NQC7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYLDQ9NQC7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYLDQ9NQC7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYLDQ9NQC7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYLDQ9NQC7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYLDQ9NQC7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CYLDQ9NQC7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYLDQ9NQC7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYLDQ9NQC7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYLDQ9NQC7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYLDQ9NQC7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYLDQ9NQC7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CYLDQ9NQC7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYLDQ9NQC7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CYLDQ9NQC7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYLDQ9NQC7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYLDQ9NQC7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYLDQ9NQC7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYLDQ9NQC7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYLDQ9NQC7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYLDQ9NQC7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYLDQ9NQC7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYLDQ9NQC7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYLDQ9NQC7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYLDQ9NQC7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYLDQ9NQC7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CYLDQ9NQC7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CYLDQ9NQC7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYLDQ9NQC7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYLDQ9NQC7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYLDQ9NQC7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYLDQ9NQC7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYLDQ9NQC7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CYLDQ9NQC7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYLDQ9NQC7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYLDQ9NQC7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYLDQ9NQC7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYLDQ9NQC7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYLDQ9NQC7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYLDQ9NQC7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
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