Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SIX2Q9NPC8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIX2Q9NPC8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIX2Q9NPC8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIX2Q9NPC8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIX2Q9NPC8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIX2Q9NPC8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIX2Q9NPC8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIX2Q9NPC8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIX2Q9NPC8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIX2Q9NPC8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIX2Q9NPC8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SIX2Q9NPC8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIX2Q9NPC8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIX2Q9NPC8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIX2Q9NPC8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIX2Q9NPC8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIX2Q9NPC8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIX2Q9NPC8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIX2Q9NPC8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIX2Q9NPC8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIX2Q9NPC8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIX2Q9NPC8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIX2Q9NPC8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIX2Q9NPC8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SIX2Q9NPC8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIX2Q9NPC8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SIX2Q9NPC8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SIX2Q9NPC8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIX2Q9NPC8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIX2Q9NPC8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIX2Q9NPC8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIX2Q9NPC8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIX2Q9NPC8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIX2Q9NPC8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SIX2Q9NPC8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIX2Q9NPC8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIX2Q9NPC8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIX2Q9NPC8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIX2Q9NPC8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIX2Q9NPC8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIX2Q9NPC8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIX2Q9NPC8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIX2Q9NPC8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIX2Q9NPC8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIX2Q9NPC8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIX2Q9NPC8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIX2Q9NPC8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIX2Q9NPC8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SIX2Q9NPC8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SIX2Q9NPC8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIX2Q9NPC8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIX2Q9NPC8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SIX2Q9NPC8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SIX2Q9NPC8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIX2Q9NPC8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIX2Q9NPC8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SIX2Q9NPC8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SIX2Q9NPC8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SIX2Q9NPC8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIX2Q9NPC8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SIX2Q9NPC8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SIX2Q9NPC8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SIX2Q9NPC8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIX2Q9NPC8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SIX2Q9NPC8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SIX2Q9NPC8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SIX2Q9NPC8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SIX2Q9NPC8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SIX2Q9NPC8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SIX2Q9NPC8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SIX2Q9NPC8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SIX2Q9NPC8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIX2Q9NPC8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIX2Q9NPC8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SIX2Q9NPC8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIX2Q9NPC8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIX2Q9NPC8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SIX2Q9NPC8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SIX2Q9NPC8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIX2Q9NPC8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIX2Q9NPC8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SIX2Q9NPC8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIX2Q9NPC8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIX2Q9NPC8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SIX2Q9NPC8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIX2Q9NPC8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SIX2Q9NPC8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIX2Q9NPC8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIX2Q9NPC8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SIX2Q9NPC8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIX2Q9NPC8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIX2Q9NPC8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIX2Q9NPC8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SIX2Q9NPC8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIX2Q9NPC8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIX2Q9NPC8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIX2Q9NPC8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIX2Q9NPC8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIX2Q9NPC8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms