Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP62

GCM1, Chorion-specific transcription factor GCMa, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM1Q9NP62 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCM1Q9NP62 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCM1Q9NP62 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCM1Q9NP62 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCM1Q9NP62 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCM1Q9NP62 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GCM1Q9NP62 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCM1Q9NP62 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCM1Q9NP62 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCM1Q9NP62 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GCM1Q9NP62 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCM1Q9NP62 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GCM1Q9NP62 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCM1Q9NP62 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCM1Q9NP62 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCM1Q9NP62 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCM1Q9NP62 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GCM1Q9NP62 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCM1Q9NP62 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCM1Q9NP62 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCM1Q9NP62 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCM1Q9NP62 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCM1Q9NP62 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCM1Q9NP62 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCM1Q9NP62 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCM1Q9NP62 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCM1Q9NP62 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCM1Q9NP62 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCM1Q9NP62 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCM1Q9NP62 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCM1Q9NP62 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCM1Q9NP62 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCM1Q9NP62 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCM1Q9NP62 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCM1Q9NP62 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCM1Q9NP62 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GCM1Q9NP62 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GCM1Q9NP62 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCM1Q9NP62 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCM1Q9NP62 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GCM1Q9NP62 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCM1Q9NP62 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCM1Q9NP62 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCM1Q9NP62 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCM1Q9NP62 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GCM1Q9NP62 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCM1Q9NP62 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCM1Q9NP62 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GCM1Q9NP62 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCM1Q9NP62 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCM1Q9NP62 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCM1Q9NP62 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCM1Q9NP62 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCM1Q9NP62 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCM1Q9NP62 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCM1Q9NP62 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCM1Q9NP62 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCM1Q9NP62 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCM1Q9NP62 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCM1Q9NP62 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCM1Q9NP62 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCM1Q9NP62 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCM1Q9NP62 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCM1Q9NP62 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCM1Q9NP62 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCM1Q9NP62 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCM1Q9NP62 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCM1Q9NP62 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCM1Q9NP62 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GCM1Q9NP62 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCM1Q9NP62 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCM1Q9NP62 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCM1Q9NP62 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCM1Q9NP62 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCM1Q9NP62 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCM1Q9NP62 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCM1Q9NP62 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCM1Q9NP62 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GCM1Q9NP62 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCM1Q9NP62 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCM1Q9NP62 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCM1Q9NP62 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCM1Q9NP62 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCM1Q9NP62 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCM1Q9NP62 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCM1Q9NP62 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCM1Q9NP62 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GCM1Q9NP62 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCM1Q9NP62 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCM1Q9NP62 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCM1Q9NP62 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCM1Q9NP62 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCM1Q9NP62 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GCM1Q9NP62 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCM1Q9NP62 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCM1Q9NP62 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCM1Q9NP62 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCM1Q9NP62 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCM1Q9NP62 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCM1Q9NP62 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms