Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCCC2Q9HCC0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCCC2Q9HCC0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCCC2Q9HCC0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCCC2Q9HCC0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCCC2Q9HCC0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCCC2Q9HCC0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCCC2Q9HCC0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCCC2Q9HCC0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MCCC2Q9HCC0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCCC2Q9HCC0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCCC2Q9HCC0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCCC2Q9HCC0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCCC2Q9HCC0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCCC2Q9HCC0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCCC2Q9HCC0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCCC2Q9HCC0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCCC2Q9HCC0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCCC2Q9HCC0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCCC2Q9HCC0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCCC2Q9HCC0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCCC2Q9HCC0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCCC2Q9HCC0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCCC2Q9HCC0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCCC2Q9HCC0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCCC2Q9HCC0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCCC2Q9HCC0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCCC2Q9HCC0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCCC2Q9HCC0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCCC2Q9HCC0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCCC2Q9HCC0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCCC2Q9HCC0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCCC2Q9HCC0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCCC2Q9HCC0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCCC2Q9HCC0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCCC2Q9HCC0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCCC2Q9HCC0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCCC2Q9HCC0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCCC2Q9HCC0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCCC2Q9HCC0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCCC2Q9HCC0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCCC2Q9HCC0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCCC2Q9HCC0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCCC2Q9HCC0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCCC2Q9HCC0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCCC2Q9HCC0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MCCC2Q9HCC0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCCC2Q9HCC0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MCCC2Q9HCC0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCCC2Q9HCC0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCCC2Q9HCC0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCC2Q9HCC0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCC2Q9HCC0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCCC2Q9HCC0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCCC2Q9HCC0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCCC2Q9HCC0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCC2Q9HCC0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCC2Q9HCC0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCC2Q9HCC0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCC2Q9HCC0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCC2Q9HCC0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MCCC2Q9HCC0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCCC2Q9HCC0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MCCC2Q9HCC0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCCC2Q9HCC0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCCC2Q9HCC0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCCC2Q9HCC0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCCC2Q9HCC0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCCC2Q9HCC0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCCC2Q9HCC0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCCC2Q9HCC0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCCC2Q9HCC0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCCC2Q9HCC0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCCC2Q9HCC0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCCC2Q9HCC0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCCC2Q9HCC0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCCC2Q9HCC0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCCC2Q9HCC0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCCC2Q9HCC0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCCC2Q9HCC0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCCC2Q9HCC0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCCC2Q9HCC0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCCC2Q9HCC0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MCCC2Q9HCC0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCC2Q9HCC0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCC2Q9HCC0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCC2Q9HCC0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCC2Q9HCC0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCC2Q9HCC0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCC2Q9HCC0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCC2Q9HCC0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCC2Q9HCC0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCC2Q9HCC0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCC2Q9HCC0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCC2Q9HCC0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCC2Q9HCC0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCC2Q9HCC0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCC2Q9HCC0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCC2Q9HCC0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCC2Q9HCC0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms