Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBT6

CDH20, Cadherin-20, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH20Q9HBT6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH20Q9HBT6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH20Q9HBT6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH20Q9HBT6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH20Q9HBT6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH20Q9HBT6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH20Q9HBT6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDH20Q9HBT6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDH20Q9HBT6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDH20Q9HBT6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH20Q9HBT6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH20Q9HBT6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH20Q9HBT6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH20Q9HBT6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH20Q9HBT6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH20Q9HBT6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH20Q9HBT6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH20Q9HBT6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH20Q9HBT6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH20Q9HBT6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH20Q9HBT6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH20Q9HBT6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH20Q9HBT6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH20Q9HBT6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH20Q9HBT6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH20Q9HBT6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH20Q9HBT6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH20Q9HBT6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH20Q9HBT6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH20Q9HBT6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH20Q9HBT6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH20Q9HBT6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH20Q9HBT6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH20Q9HBT6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH20Q9HBT6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH20Q9HBT6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH20Q9HBT6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH20Q9HBT6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH20Q9HBT6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH20Q9HBT6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH20Q9HBT6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH20Q9HBT6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH20Q9HBT6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH20Q9HBT6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH20Q9HBT6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH20Q9HBT6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH20Q9HBT6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH20Q9HBT6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH20Q9HBT6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH20Q9HBT6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH20Q9HBT6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH20Q9HBT6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH20Q9HBT6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH20Q9HBT6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH20Q9HBT6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH20Q9HBT6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH20Q9HBT6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH20Q9HBT6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH20Q9HBT6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH20Q9HBT6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH20Q9HBT6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH20Q9HBT6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH20Q9HBT6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH20Q9HBT6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH20Q9HBT6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH20Q9HBT6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH20Q9HBT6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH20Q9HBT6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH20Q9HBT6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH20Q9HBT6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH20Q9HBT6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH20Q9HBT6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH20Q9HBT6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH20Q9HBT6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH20Q9HBT6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH20Q9HBT6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH20Q9HBT6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH20Q9HBT6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH20Q9HBT6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH20Q9HBT6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH20Q9HBT6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH20Q9HBT6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH20Q9HBT6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH20Q9HBT6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH20Q9HBT6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH20Q9HBT6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH20Q9HBT6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH20Q9HBT6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH20Q9HBT6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH20Q9HBT6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH20Q9HBT6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH20Q9HBT6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH20Q9HBT6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH20Q9HBT6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH20Q9HBT6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH20Q9HBT6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH20Q9HBT6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH20Q9HBT6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH20Q9HBT6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH20Q9HBT6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms