Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8P0

SRD5A3, Polyprenol reductase, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRD5A3Q9H8P0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRD5A3Q9H8P0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SRD5A3Q9H8P0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SRD5A3Q9H8P0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SRD5A3Q9H8P0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRD5A3Q9H8P0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SRD5A3Q9H8P0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRD5A3Q9H8P0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRD5A3Q9H8P0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRD5A3Q9H8P0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SRD5A3Q9H8P0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SRD5A3Q9H8P0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRD5A3Q9H8P0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRD5A3Q9H8P0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRD5A3Q9H8P0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRD5A3Q9H8P0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRD5A3Q9H8P0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRD5A3Q9H8P0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRD5A3Q9H8P0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRD5A3Q9H8P0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRD5A3Q9H8P0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRD5A3Q9H8P0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRD5A3Q9H8P0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRD5A3Q9H8P0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRD5A3Q9H8P0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRD5A3Q9H8P0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRD5A3Q9H8P0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRD5A3Q9H8P0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRD5A3Q9H8P0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRD5A3Q9H8P0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRD5A3Q9H8P0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRD5A3Q9H8P0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRD5A3Q9H8P0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRD5A3Q9H8P0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRD5A3Q9H8P0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRD5A3Q9H8P0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRD5A3Q9H8P0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRD5A3Q9H8P0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRD5A3Q9H8P0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRD5A3Q9H8P0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRD5A3Q9H8P0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRD5A3Q9H8P0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRD5A3Q9H8P0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRD5A3Q9H8P0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRD5A3Q9H8P0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRD5A3Q9H8P0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRD5A3Q9H8P0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRD5A3Q9H8P0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRD5A3Q9H8P0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRD5A3Q9H8P0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRD5A3Q9H8P0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRD5A3Q9H8P0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRD5A3Q9H8P0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRD5A3Q9H8P0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRD5A3Q9H8P0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRD5A3Q9H8P0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRD5A3Q9H8P0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SRD5A3Q9H8P0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRD5A3Q9H8P0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRD5A3Q9H8P0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRD5A3Q9H8P0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRD5A3Q9H8P0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRD5A3Q9H8P0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRD5A3Q9H8P0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRD5A3Q9H8P0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRD5A3Q9H8P0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRD5A3Q9H8P0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRD5A3Q9H8P0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRD5A3Q9H8P0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRD5A3Q9H8P0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRD5A3Q9H8P0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRD5A3Q9H8P0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRD5A3Q9H8P0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRD5A3Q9H8P0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRD5A3Q9H8P0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRD5A3Q9H8P0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRD5A3Q9H8P0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRD5A3Q9H8P0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SRD5A3Q9H8P0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRD5A3Q9H8P0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SRD5A3Q9H8P0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRD5A3Q9H8P0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRD5A3Q9H8P0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SRD5A3Q9H8P0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SRD5A3Q9H8P0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SRD5A3Q9H8P0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRD5A3Q9H8P0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRD5A3Q9H8P0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRD5A3Q9H8P0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRD5A3Q9H8P0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRD5A3Q9H8P0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRD5A3Q9H8P0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRD5A3Q9H8P0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRD5A3Q9H8P0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRD5A3Q9H8P0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRD5A3Q9H8P0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRD5A3Q9H8P0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRD5A3Q9H8P0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SRD5A3Q9H8P0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SRD5A3Q9H8P0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms