Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7X7

IFT22, Intraflagellar transport protein 22 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT22Q9H7X7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT22Q9H7X7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT22Q9H7X7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IFT22Q9H7X7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT22Q9H7X7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT22Q9H7X7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT22Q9H7X7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT22Q9H7X7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT22Q9H7X7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT22Q9H7X7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT22Q9H7X7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT22Q9H7X7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT22Q9H7X7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT22Q9H7X7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT22Q9H7X7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT22Q9H7X7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT22Q9H7X7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT22Q9H7X7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT22Q9H7X7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT22Q9H7X7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT22Q9H7X7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT22Q9H7X7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT22Q9H7X7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT22Q9H7X7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT22Q9H7X7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT22Q9H7X7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT22Q9H7X7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT22Q9H7X7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT22Q9H7X7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT22Q9H7X7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT22Q9H7X7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT22Q9H7X7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT22Q9H7X7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFT22Q9H7X7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT22Q9H7X7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT22Q9H7X7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT22Q9H7X7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFT22Q9H7X7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT22Q9H7X7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT22Q9H7X7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT22Q9H7X7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT22Q9H7X7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT22Q9H7X7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT22Q9H7X7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT22Q9H7X7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT22Q9H7X7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT22Q9H7X7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT22Q9H7X7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT22Q9H7X7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT22Q9H7X7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT22Q9H7X7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT22Q9H7X7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT22Q9H7X7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT22Q9H7X7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT22Q9H7X7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT22Q9H7X7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT22Q9H7X7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT22Q9H7X7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT22Q9H7X7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT22Q9H7X7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT22Q9H7X7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT22Q9H7X7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT22Q9H7X7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT22Q9H7X7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT22Q9H7X7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT22Q9H7X7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT22Q9H7X7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT22Q9H7X7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFT22Q9H7X7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT22Q9H7X7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT22Q9H7X7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT22Q9H7X7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT22Q9H7X7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT22Q9H7X7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT22Q9H7X7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT22Q9H7X7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT22Q9H7X7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT22Q9H7X7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT22Q9H7X7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT22Q9H7X7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT22Q9H7X7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT22Q9H7X7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT22Q9H7X7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT22Q9H7X7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT22Q9H7X7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT22Q9H7X7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT22Q9H7X7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT22Q9H7X7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT22Q9H7X7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT22Q9H7X7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFT22Q9H7X7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFT22Q9H7X7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT22Q9H7X7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT22Q9H7X7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT22Q9H7X7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT22Q9H7X7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT22Q9H7X7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT22Q9H7X7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT22Q9H7X7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT22Q9H7X7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms