Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
XKR8Q9H6D3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
XKR8Q9H6D3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
XKR8Q9H6D3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XKR8Q9H6D3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XKR8Q9H6D3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XKR8Q9H6D3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XKR8Q9H6D3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XKR8Q9H6D3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XKR8Q9H6D3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
XKR8Q9H6D3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XKR8Q9H6D3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
XKR8Q9H6D3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
XKR8Q9H6D3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XKR8Q9H6D3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XKR8Q9H6D3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
XKR8Q9H6D3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XKR8Q9H6D3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
XKR8Q9H6D3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
XKR8Q9H6D3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XKR8Q9H6D3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XKR8Q9H6D3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XKR8Q9H6D3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
XKR8Q9H6D3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XKR8Q9H6D3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XKR8Q9H6D3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
XKR8Q9H6D3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XKR8Q9H6D3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XKR8Q9H6D3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
XKR8Q9H6D3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XKR8Q9H6D3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XKR8Q9H6D3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XKR8Q9H6D3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XKR8Q9H6D3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
XKR8Q9H6D3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XKR8Q9H6D3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XKR8Q9H6D3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XKR8Q9H6D3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XKR8Q9H6D3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
XKR8Q9H6D3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XKR8Q9H6D3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XKR8Q9H6D3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XKR8Q9H6D3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XKR8Q9H6D3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
XKR8Q9H6D3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XKR8Q9H6D3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XKR8Q9H6D3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XKR8Q9H6D3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
XKR8Q9H6D3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XKR8Q9H6D3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
XKR8Q9H6D3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XKR8Q9H6D3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XKR8Q9H6D3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XKR8Q9H6D3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XKR8Q9H6D3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
XKR8Q9H6D3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
XKR8Q9H6D3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
XKR8Q9H6D3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XKR8Q9H6D3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XKR8Q9H6D3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
XKR8Q9H6D3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XKR8Q9H6D3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XKR8Q9H6D3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XKR8Q9H6D3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XKR8Q9H6D3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XKR8Q9H6D3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XKR8Q9H6D3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
XKR8Q9H6D3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XKR8Q9H6D3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
XKR8Q9H6D3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XKR8Q9H6D3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
XKR8Q9H6D3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
XKR8Q9H6D3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
XKR8Q9H6D3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms