Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
XKR8Q9H6D3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
XKR8Q9H6D3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
XKR8Q9H6D3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
XKR8Q9H6D3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
XKR8Q9H6D3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
XKR8Q9H6D3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
XKR8Q9H6D3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
XKR8Q9H6D3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
XKR8Q9H6D3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
XKR8Q9H6D3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
XKR8Q9H6D3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
XKR8Q9H6D3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
XKR8Q9H6D3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
XKR8Q9H6D3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
XKR8Q9H6D3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
XKR8Q9H6D3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
XKR8Q9H6D3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
XKR8Q9H6D3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
XKR8Q9H6D3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
XKR8Q9H6D3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
XKR8Q9H6D3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
XKR8Q9H6D3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
XKR8Q9H6D3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
XKR8Q9H6D3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
XKR8Q9H6D3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
XKR8Q9H6D3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
XKR8Q9H6D3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
XKR8Q9H6D3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
XKR8Q9H6D3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
XKR8Q9H6D3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
XKR8Q9H6D3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
XKR8Q9H6D3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
XKR8Q9H6D3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
XKR8Q9H6D3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
XKR8Q9H6D3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
XKR8Q9H6D3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
XKR8Q9H6D3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
XKR8Q9H6D3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
XKR8Q9H6D3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
XKR8Q9H6D3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
XKR8Q9H6D3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
XKR8Q9H6D3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
XKR8Q9H6D3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
XKR8Q9H6D3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
XKR8Q9H6D3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
XKR8Q9H6D3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
XKR8Q9H6D3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
XKR8Q9H6D3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
XKR8Q9H6D3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
XKR8Q9H6D3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
XKR8Q9H6D3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
XKR8Q9H6D3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
XKR8Q9H6D3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
XKR8Q9H6D3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
XKR8Q9H6D3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
XKR8Q9H6D3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
XKR8Q9H6D3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
XKR8Q9H6D3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
XKR8Q9H6D3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
XKR8Q9H6D3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
XKR8Q9H6D3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
XKR8Q9H6D3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
XKR8Q9H6D3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
XKR8Q9H6D3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
XKR8Q9H6D3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
XKR8Q9H6D3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XKR8Q9H6D3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
XKR8Q9H6D3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
XKR8Q9H6D3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
XKR8Q9H6D3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
XKR8Q9H6D3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
XKR8Q9H6D3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XKR8Q9H6D3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
XKR8Q9H6D3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
XKR8Q9H6D3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
XKR8Q9H6D3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
XKR8Q9H6D3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XKR8Q9H6D3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
XKR8Q9H6D3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
XKR8Q9H6D3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
XKR8Q9H6D3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XKR8Q9H6D3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
XKR8Q9H6D3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
XKR8Q9H6D3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
XKR8Q9H6D3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
XKR8Q9H6D3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
XKR8Q9H6D3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
XKR8Q9H6D3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
XKR8Q9H6D3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
XKR8Q9H6D3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
XKR8Q9H6D3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
XKR8Q9H6D3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
XKR8Q9H6D3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
XKR8Q9H6D3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
XKR8Q9H6D3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
XKR8Q9H6D3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
XKR8Q9H6D3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
XKR8Q9H6D3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XKR8Q9H6D3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms