Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0H3

KLHL25, Kelch-like protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL25Q9H0H3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL25Q9H0H3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL25Q9H0H3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL25Q9H0H3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL25Q9H0H3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL25Q9H0H3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL25Q9H0H3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL25Q9H0H3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL25Q9H0H3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL25Q9H0H3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL25Q9H0H3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL25Q9H0H3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL25Q9H0H3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL25Q9H0H3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHL25Q9H0H3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL25Q9H0H3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL25Q9H0H3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL25Q9H0H3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL25Q9H0H3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL25Q9H0H3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KLHL25Q9H0H3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL25Q9H0H3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL25Q9H0H3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL25Q9H0H3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL25Q9H0H3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL25Q9H0H3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL25Q9H0H3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL25Q9H0H3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL25Q9H0H3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL25Q9H0H3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL25Q9H0H3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL25Q9H0H3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL25Q9H0H3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL25Q9H0H3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL25Q9H0H3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHL25Q9H0H3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KLHL25Q9H0H3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
KLHL25Q9H0H3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL25Q9H0H3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL25Q9H0H3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL25Q9H0H3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL25Q9H0H3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL25Q9H0H3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL25Q9H0H3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL25Q9H0H3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL25Q9H0H3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL25Q9H0H3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL25Q9H0H3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL25Q9H0H3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL25Q9H0H3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL25Q9H0H3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL25Q9H0H3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL25Q9H0H3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL25Q9H0H3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL25Q9H0H3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL25Q9H0H3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL25Q9H0H3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL25Q9H0H3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL25Q9H0H3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL25Q9H0H3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL25Q9H0H3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL25Q9H0H3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL25Q9H0H3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL25Q9H0H3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL25Q9H0H3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL25Q9H0H3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL25Q9H0H3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL25Q9H0H3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL25Q9H0H3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL25Q9H0H3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL25Q9H0H3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL25Q9H0H3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL25Q9H0H3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL25Q9H0H3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL25Q9H0H3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL25Q9H0H3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL25Q9H0H3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL25Q9H0H3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL25Q9H0H3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL25Q9H0H3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL25Q9H0H3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL25Q9H0H3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL25Q9H0H3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL25Q9H0H3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL25Q9H0H3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL25Q9H0H3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL25Q9H0H3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL25Q9H0H3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL25Q9H0H3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL25Q9H0H3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL25Q9H0H3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL25Q9H0H3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL25Q9H0H3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL25Q9H0H3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL25Q9H0H3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL25Q9H0H3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL25Q9H0H3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL25Q9H0H3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL25Q9H0H3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL25Q9H0H3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms