Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM4Q9C037 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM4Q9C037 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM4Q9C037 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM4Q9C037 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM4Q9C037 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM4Q9C037 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM4Q9C037 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM4Q9C037 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM4Q9C037 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM4Q9C037 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM4Q9C037 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM4Q9C037 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM4Q9C037 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM4Q9C037 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM4Q9C037 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM4Q9C037 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM4Q9C037 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM4Q9C037 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM4Q9C037 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM4Q9C037 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM4Q9C037 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM4Q9C037 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM4Q9C037 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM4Q9C037 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM4Q9C037 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM4Q9C037 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM4Q9C037 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM4Q9C037 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM4Q9C037 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM4Q9C037 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM4Q9C037 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM4Q9C037 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM4Q9C037 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM4Q9C037 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM4Q9C037 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM4Q9C037 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM4Q9C037 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM4Q9C037 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM4Q9C037 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM4Q9C037 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM4Q9C037 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM4Q9C037 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM4Q9C037 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM4Q9C037 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM4Q9C037 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM4Q9C037 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM4Q9C037 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM4Q9C037 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM4Q9C037 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM4Q9C037 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM4Q9C037 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM4Q9C037 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM4Q9C037 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM4Q9C037 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM4Q9C037 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM4Q9C037 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM4Q9C037 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM4Q9C037 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM4Q9C037 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM4Q9C037 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM4Q9C037 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM4Q9C037 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM4Q9C037 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM4Q9C037 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM4Q9C037 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM4Q9C037 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM4Q9C037 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM4Q9C037 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM4Q9C037 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM4Q9C037 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM4Q9C037 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM4Q9C037 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM4Q9C037 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM4Q9C037 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM4Q9C037 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM4Q9C037 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM4Q9C037 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM4Q9C037 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM4Q9C037 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM4Q9C037 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM4Q9C037 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM4Q9C037 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM4Q9C037 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM4Q9C037 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM4Q9C037 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM4Q9C037 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM4Q9C037 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM4Q9C037 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM4Q9C037 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM4Q9C037 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM4Q9C037 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM4Q9C037 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM4Q9C037 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM4Q9C037 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM4Q9C037 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM4Q9C037 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM4Q9C037 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM4Q9C037 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM4Q9C037 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms