Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LSM14BQ9BX40 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LSM14BQ9BX40 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LSM14BQ9BX40 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LSM14BQ9BX40 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LSM14BQ9BX40 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LSM14BQ9BX40 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LSM14BQ9BX40 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LSM14BQ9BX40 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LSM14BQ9BX40 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LSM14BQ9BX40 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LSM14BQ9BX40 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LSM14BQ9BX40 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LSM14BQ9BX40 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LSM14BQ9BX40 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LSM14BQ9BX40 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LSM14BQ9BX40 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LSM14BQ9BX40 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LSM14BQ9BX40 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LSM14BQ9BX40 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
LSM14BQ9BX40 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LSM14BQ9BX40 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LSM14BQ9BX40 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LSM14BQ9BX40 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LSM14BQ9BX40 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LSM14BQ9BX40 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LSM14BQ9BX40 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LSM14BQ9BX40 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LSM14BQ9BX40 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LSM14BQ9BX40 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LSM14BQ9BX40 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LSM14BQ9BX40 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LSM14BQ9BX40 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LSM14BQ9BX40 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LSM14BQ9BX40 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LSM14BQ9BX40 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
LSM14BQ9BX40 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
LSM14BQ9BX40 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LSM14BQ9BX40 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LSM14BQ9BX40 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LSM14BQ9BX40 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LSM14BQ9BX40 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LSM14BQ9BX40 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LSM14BQ9BX40 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LSM14BQ9BX40 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LSM14BQ9BX40 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LSM14BQ9BX40 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LSM14BQ9BX40 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LSM14BQ9BX40 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LSM14BQ9BX40 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LSM14BQ9BX40 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LSM14BQ9BX40 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LSM14BQ9BX40 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LSM14BQ9BX40 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LSM14BQ9BX40 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LSM14BQ9BX40 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LSM14BQ9BX40 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LSM14BQ9BX40 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LSM14BQ9BX40 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LSM14BQ9BX40 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LSM14BQ9BX40 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LSM14BQ9BX40 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LSM14BQ9BX40 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LSM14BQ9BX40 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LSM14BQ9BX40 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LSM14BQ9BX40 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LSM14BQ9BX40 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LSM14BQ9BX40 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LSM14BQ9BX40 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LSM14BQ9BX40 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LSM14BQ9BX40 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
LSM14BQ9BX40 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LSM14BQ9BX40 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LSM14BQ9BX40 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LSM14BQ9BX40 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LSM14BQ9BX40 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LSM14BQ9BX40 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LSM14BQ9BX40 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LSM14BQ9BX40 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LSM14BQ9BX40 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LSM14BQ9BX40 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LSM14BQ9BX40 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LSM14BQ9BX40 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LSM14BQ9BX40 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LSM14BQ9BX40 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LSM14BQ9BX40 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LSM14BQ9BX40 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LSM14BQ9BX40 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LSM14BQ9BX40 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LSM14BQ9BX40 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LSM14BQ9BX40 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LSM14BQ9BX40 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LSM14BQ9BX40 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LSM14BQ9BX40 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LSM14BQ9BX40 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LSM14BQ9BX40 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LSM14BQ9BX40 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LSM14BQ9BX40 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LSM14BQ9BX40 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LSM14BQ9BX40 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms