Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYT11Q9BT88 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYT11Q9BT88 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYT11Q9BT88 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYT11Q9BT88 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYT11Q9BT88 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYT11Q9BT88 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYT11Q9BT88 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYT11Q9BT88 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYT11Q9BT88 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYT11Q9BT88 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYT11Q9BT88 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYT11Q9BT88 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYT11Q9BT88 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SYT11Q9BT88 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYT11Q9BT88 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYT11Q9BT88 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYT11Q9BT88 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYT11Q9BT88 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYT11Q9BT88 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYT11Q9BT88 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYT11Q9BT88 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYT11Q9BT88 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYT11Q9BT88 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYT11Q9BT88 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYT11Q9BT88 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYT11Q9BT88 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYT11Q9BT88 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYT11Q9BT88 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYT11Q9BT88 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYT11Q9BT88 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYT11Q9BT88 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SYT11Q9BT88 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYT11Q9BT88 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYT11Q9BT88 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYT11Q9BT88 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYT11Q9BT88 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYT11Q9BT88 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYT11Q9BT88 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYT11Q9BT88 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYT11Q9BT88 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYT11Q9BT88 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYT11Q9BT88 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYT11Q9BT88 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYT11Q9BT88 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYT11Q9BT88 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYT11Q9BT88 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYT11Q9BT88 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYT11Q9BT88 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYT11Q9BT88 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYT11Q9BT88 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYT11Q9BT88 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYT11Q9BT88 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYT11Q9BT88 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYT11Q9BT88 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYT11Q9BT88 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYT11Q9BT88 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYT11Q9BT88 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYT11Q9BT88 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYT11Q9BT88 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYT11Q9BT88 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYT11Q9BT88 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYT11Q9BT88 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SYT11Q9BT88 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYT11Q9BT88 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYT11Q9BT88 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYT11Q9BT88 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SYT11Q9BT88 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYT11Q9BT88 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYT11Q9BT88 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYT11Q9BT88 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYT11Q9BT88 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYT11Q9BT88 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYT11Q9BT88 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYT11Q9BT88 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYT11Q9BT88 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYT11Q9BT88 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYT11Q9BT88 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYT11Q9BT88 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYT11Q9BT88 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYT11Q9BT88 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYT11Q9BT88 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYT11Q9BT88 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SYT11Q9BT88 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SYT11Q9BT88 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYT11Q9BT88 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYT11Q9BT88 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYT11Q9BT88 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYT11Q9BT88 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYT11Q9BT88 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYT11Q9BT88 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYT11Q9BT88 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYT11Q9BT88 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYT11Q9BT88 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYT11Q9BT88 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYT11Q9BT88 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYT11Q9BT88 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYT11Q9BT88 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYT11Q9BT88 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYT11Q9BT88 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms