Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM79Q9BSE2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM79Q9BSE2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM79Q9BSE2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM79Q9BSE2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM79Q9BSE2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM79Q9BSE2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM79Q9BSE2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM79Q9BSE2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM79Q9BSE2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM79Q9BSE2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM79Q9BSE2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM79Q9BSE2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM79Q9BSE2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM79Q9BSE2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM79Q9BSE2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM79Q9BSE2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM79Q9BSE2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM79Q9BSE2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM79Q9BSE2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM79Q9BSE2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM79Q9BSE2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM79Q9BSE2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM79Q9BSE2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM79Q9BSE2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM79Q9BSE2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM79Q9BSE2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM79Q9BSE2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM79Q9BSE2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM79Q9BSE2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM79Q9BSE2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM79Q9BSE2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM79Q9BSE2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM79Q9BSE2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM79Q9BSE2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM79Q9BSE2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM79Q9BSE2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM79Q9BSE2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM79Q9BSE2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM79Q9BSE2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TMEM79Q9BSE2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM79Q9BSE2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM79Q9BSE2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM79Q9BSE2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM79Q9BSE2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM79Q9BSE2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM79Q9BSE2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM79Q9BSE2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM79Q9BSE2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM79Q9BSE2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM79Q9BSE2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM79Q9BSE2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM79Q9BSE2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM79Q9BSE2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM79Q9BSE2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM79Q9BSE2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM79Q9BSE2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM79Q9BSE2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM79Q9BSE2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM79Q9BSE2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM79Q9BSE2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM79Q9BSE2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM79Q9BSE2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM79Q9BSE2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM79Q9BSE2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM79Q9BSE2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM79Q9BSE2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM79Q9BSE2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM79Q9BSE2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM79Q9BSE2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM79Q9BSE2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM79Q9BSE2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM79Q9BSE2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM79Q9BSE2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM79Q9BSE2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM79Q9BSE2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM79Q9BSE2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM79Q9BSE2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM79Q9BSE2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM79Q9BSE2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM79Q9BSE2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM79Q9BSE2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM79Q9BSE2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM79Q9BSE2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM79Q9BSE2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM79Q9BSE2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM79Q9BSE2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM79Q9BSE2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM79Q9BSE2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM79Q9BSE2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM79Q9BSE2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM79Q9BSE2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM79Q9BSE2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM79Q9BSE2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM79Q9BSE2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM79Q9BSE2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM79Q9BSE2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM79Q9BSE2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM79Q9BSE2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM79Q9BSE2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms