Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ83

SLX1A, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1AQ9BQ83 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLX1AQ9BQ83 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLX1AQ9BQ83 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLX1AQ9BQ83 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLX1AQ9BQ83 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLX1AQ9BQ83 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLX1AQ9BQ83 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLX1AQ9BQ83 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLX1AQ9BQ83 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLX1AQ9BQ83 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLX1AQ9BQ83 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLX1AQ9BQ83 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLX1AQ9BQ83 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLX1AQ9BQ83 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLX1AQ9BQ83 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLX1AQ9BQ83 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLX1AQ9BQ83 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLX1AQ9BQ83 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLX1AQ9BQ83 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLX1AQ9BQ83 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLX1AQ9BQ83 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLX1AQ9BQ83 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLX1AQ9BQ83 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLX1AQ9BQ83 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLX1AQ9BQ83 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLX1AQ9BQ83 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLX1AQ9BQ83 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLX1AQ9BQ83 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLX1AQ9BQ83 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLX1AQ9BQ83 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLX1AQ9BQ83 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLX1AQ9BQ83 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLX1AQ9BQ83 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLX1AQ9BQ83 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLX1AQ9BQ83 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLX1AQ9BQ83 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLX1AQ9BQ83 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLX1AQ9BQ83 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLX1AQ9BQ83 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLX1AQ9BQ83 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLX1AQ9BQ83 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLX1AQ9BQ83 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLX1AQ9BQ83 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLX1AQ9BQ83 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLX1AQ9BQ83 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLX1AQ9BQ83 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLX1AQ9BQ83 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLX1AQ9BQ83 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLX1AQ9BQ83 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLX1AQ9BQ83 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLX1AQ9BQ83 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLX1AQ9BQ83 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLX1AQ9BQ83 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLX1AQ9BQ83 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLX1AQ9BQ83 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLX1AQ9BQ83 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLX1AQ9BQ83 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLX1AQ9BQ83 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLX1AQ9BQ83 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLX1AQ9BQ83 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLX1AQ9BQ83 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLX1AQ9BQ83 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLX1AQ9BQ83 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLX1AQ9BQ83 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLX1AQ9BQ83 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLX1AQ9BQ83 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLX1AQ9BQ83 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLX1AQ9BQ83 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLX1AQ9BQ83 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLX1AQ9BQ83 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLX1AQ9BQ83 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLX1AQ9BQ83 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLX1AQ9BQ83 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLX1AQ9BQ83 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLX1AQ9BQ83 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLX1AQ9BQ83 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLX1AQ9BQ83 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLX1AQ9BQ83 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLX1AQ9BQ83 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLX1AQ9BQ83 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLX1AQ9BQ83 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLX1AQ9BQ83 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLX1AQ9BQ83 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLX1AQ9BQ83 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLX1AQ9BQ83 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLX1AQ9BQ83 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLX1AQ9BQ83 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLX1AQ9BQ83 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLX1AQ9BQ83 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLX1AQ9BQ83 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLX1AQ9BQ83 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLX1AQ9BQ83 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLX1AQ9BQ83 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLX1AQ9BQ83 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLX1AQ9BQ83 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLX1AQ9BQ83 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLX1AQ9BQ83 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLX1AQ9BQ83 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLX1AQ9BQ83 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLX1AQ9BQ83 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms