Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ83

SLX1A, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1AQ9BQ83 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SLX1AQ9BQ83 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SLX1AQ9BQ83 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLX1AQ9BQ83 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLX1AQ9BQ83 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLX1AQ9BQ83 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLX1AQ9BQ83 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLX1AQ9BQ83 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLX1AQ9BQ83 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SLX1AQ9BQ83 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLX1AQ9BQ83 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLX1AQ9BQ83 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLX1AQ9BQ83 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLX1AQ9BQ83 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLX1AQ9BQ83 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLX1AQ9BQ83 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLX1AQ9BQ83 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLX1AQ9BQ83 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLX1AQ9BQ83 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SLX1AQ9BQ83 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLX1AQ9BQ83 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLX1AQ9BQ83 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLX1AQ9BQ83 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLX1AQ9BQ83 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLX1AQ9BQ83 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLX1AQ9BQ83 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLX1AQ9BQ83 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLX1AQ9BQ83 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLX1AQ9BQ83 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLX1AQ9BQ83 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLX1AQ9BQ83 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLX1AQ9BQ83 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLX1AQ9BQ83 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLX1AQ9BQ83 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLX1AQ9BQ83 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLX1AQ9BQ83 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SLX1AQ9BQ83 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLX1AQ9BQ83 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLX1AQ9BQ83 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLX1AQ9BQ83 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SLX1AQ9BQ83 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLX1AQ9BQ83 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLX1AQ9BQ83 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLX1AQ9BQ83 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLX1AQ9BQ83 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLX1AQ9BQ83 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SLX1AQ9BQ83 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLX1AQ9BQ83 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLX1AQ9BQ83 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLX1AQ9BQ83 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLX1AQ9BQ83 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLX1AQ9BQ83 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLX1AQ9BQ83 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLX1AQ9BQ83 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLX1AQ9BQ83 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLX1AQ9BQ83 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLX1AQ9BQ83 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLX1AQ9BQ83 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLX1AQ9BQ83 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLX1AQ9BQ83 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLX1AQ9BQ83 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLX1AQ9BQ83 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLX1AQ9BQ83 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLX1AQ9BQ83 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLX1AQ9BQ83 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLX1AQ9BQ83 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLX1AQ9BQ83 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLX1AQ9BQ83 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLX1AQ9BQ83 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLX1AQ9BQ83 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLX1AQ9BQ83 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLX1AQ9BQ83 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLX1AQ9BQ83 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLX1AQ9BQ83 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLX1AQ9BQ83 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLX1AQ9BQ83 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLX1AQ9BQ83 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLX1AQ9BQ83 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLX1AQ9BQ83 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLX1AQ9BQ83 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLX1AQ9BQ83 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLX1AQ9BQ83 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLX1AQ9BQ83 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLX1AQ9BQ83 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLX1AQ9BQ83 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLX1AQ9BQ83 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLX1AQ9BQ83 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLX1AQ9BQ83 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLX1AQ9BQ83 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLX1AQ9BQ83 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLX1AQ9BQ83 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SLX1AQ9BQ83 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLX1AQ9BQ83 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLX1AQ9BQ83 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLX1AQ9BQ83 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLX1AQ9BQ83 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLX1AQ9BQ83 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLX1AQ9BQ83 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLX1AQ9BQ83 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLX1AQ9BQ83 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms