Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NDNQ99608 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NDNQ99608 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NDNQ99608 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NDNQ99608 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NDNQ99608 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NDNQ99608 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NDNQ99608 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NDNQ99608 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NDNQ99608 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NDNQ99608 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NDNQ99608 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NDNQ99608 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NDNQ99608 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NDNQ99608 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NDNQ99608 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NDNQ99608 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NDNQ99608 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NDNQ99608 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NDNQ99608 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NDNQ99608 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NDNQ99608 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NDNQ99608 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NDNQ99608 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NDNQ99608 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NDNQ99608 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NDNQ99608 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NDNQ99608 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NDNQ99608 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NDNQ99608 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NDNQ99608 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NDNQ99608 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NDNQ99608 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NDNQ99608 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NDNQ99608 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NDNQ99608 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NDNQ99608 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NDNQ99608 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NDNQ99608 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NDNQ99608 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NDNQ99608 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NDNQ99608 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NDNQ99608 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NDNQ99608 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NDNQ99608 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NDNQ99608 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NDNQ99608 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NDNQ99608 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NDNQ99608 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NDNQ99608 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NDNQ99608 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NDNQ99608 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NDNQ99608 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NDNQ99608 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NDNQ99608 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NDNQ99608 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NDNQ99608 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NDNQ99608 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NDNQ99608 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NDNQ99608 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NDNQ99608 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NDNQ99608 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NDNQ99608 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NDNQ99608 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NDNQ99608 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NDNQ99608 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NDNQ99608 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NDNQ99608 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NDNQ99608 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NDNQ99608 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NDNQ99608 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NDNQ99608 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NDNQ99608 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NDNQ99608 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NDNQ99608 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NDNQ99608 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NDNQ99608 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NDNQ99608 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NDNQ99608 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NDNQ99608 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NDNQ99608 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NDNQ99608 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NDNQ99608 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NDNQ99608 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NDNQ99608 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NDNQ99608 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NDNQ99608 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NDNQ99608 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NDNQ99608 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NDNQ99608 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NDNQ99608 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NDNQ99608 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NDNQ99608 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NDNQ99608 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NDNQ99608 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NDNQ99608 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NDNQ99608 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NDNQ99608 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NDNQ99608 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NDNQ99608 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms