Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF3Q96PU9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF3Q96PU9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF3Q96PU9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF3Q96PU9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF3Q96PU9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF3Q96PU9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF3Q96PU9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF3Q96PU9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF3Q96PU9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF3Q96PU9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF3Q96PU9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF3Q96PU9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF3Q96PU9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF3Q96PU9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODF3Q96PU9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ODF3Q96PU9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF3Q96PU9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF3Q96PU9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF3Q96PU9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF3Q96PU9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF3Q96PU9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF3Q96PU9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF3Q96PU9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF3Q96PU9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF3Q96PU9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF3Q96PU9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF3Q96PU9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF3Q96PU9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF3Q96PU9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF3Q96PU9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF3Q96PU9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF3Q96PU9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ODF3Q96PU9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF3Q96PU9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF3Q96PU9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ODF3Q96PU9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF3Q96PU9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF3Q96PU9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ODF3Q96PU9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF3Q96PU9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF3Q96PU9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF3Q96PU9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ODF3Q96PU9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF3Q96PU9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF3Q96PU9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ODF3Q96PU9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF3Q96PU9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF3Q96PU9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF3Q96PU9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ODF3Q96PU9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF3Q96PU9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ODF3Q96PU9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ODF3Q96PU9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF3Q96PU9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ODF3Q96PU9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODF3Q96PU9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODF3Q96PU9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF3Q96PU9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF3Q96PU9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF3Q96PU9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF3Q96PU9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODF3Q96PU9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF3Q96PU9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF3Q96PU9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF3Q96PU9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODF3Q96PU9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF3Q96PU9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF3Q96PU9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF3Q96PU9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF3Q96PU9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODF3Q96PU9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ODF3Q96PU9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF3Q96PU9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF3Q96PU9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF3Q96PU9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF3Q96PU9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF3Q96PU9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF3Q96PU9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF3Q96PU9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF3Q96PU9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF3Q96PU9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF3Q96PU9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODF3Q96PU9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODF3Q96PU9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODF3Q96PU9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODF3Q96PU9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODF3Q96PU9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODF3Q96PU9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ODF3Q96PU9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODF3Q96PU9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODF3Q96PU9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODF3Q96PU9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF3Q96PU9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODF3Q96PU9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF3Q96PU9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODF3Q96PU9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF3Q96PU9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF3Q96PU9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODF3Q96PU9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms