Protein–RNA interactions for Protein: Q96LI5

CNOT6L, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6LQ96LI5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CNOT6LQ96LI5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CNOT6LQ96LI5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CNOT6LQ96LI5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CNOT6LQ96LI5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CNOT6LQ96LI5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CNOT6LQ96LI5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
CNOT6LQ96LI5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CNOT6LQ96LI5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CNOT6LQ96LI5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CNOT6LQ96LI5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CNOT6LQ96LI5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CNOT6LQ96LI5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNOT6LQ96LI5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNOT6LQ96LI5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNOT6LQ96LI5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNOT6LQ96LI5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNOT6LQ96LI5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CNOT6LQ96LI5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CNOT6LQ96LI5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CNOT6LQ96LI5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CNOT6LQ96LI5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNOT6LQ96LI5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNOT6LQ96LI5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNOT6LQ96LI5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNOT6LQ96LI5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNOT6LQ96LI5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNOT6LQ96LI5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNOT6LQ96LI5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNOT6LQ96LI5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNOT6LQ96LI5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNOT6LQ96LI5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNOT6LQ96LI5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNOT6LQ96LI5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CNOT6LQ96LI5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNOT6LQ96LI5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNOT6LQ96LI5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNOT6LQ96LI5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNOT6LQ96LI5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNOT6LQ96LI5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNOT6LQ96LI5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNOT6LQ96LI5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNOT6LQ96LI5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNOT6LQ96LI5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNOT6LQ96LI5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNOT6LQ96LI5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNOT6LQ96LI5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNOT6LQ96LI5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNOT6LQ96LI5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNOT6LQ96LI5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNOT6LQ96LI5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNOT6LQ96LI5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNOT6LQ96LI5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNOT6LQ96LI5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNOT6LQ96LI5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNOT6LQ96LI5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNOT6LQ96LI5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNOT6LQ96LI5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNOT6LQ96LI5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNOT6LQ96LI5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNOT6LQ96LI5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNOT6LQ96LI5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNOT6LQ96LI5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNOT6LQ96LI5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNOT6LQ96LI5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNOT6LQ96LI5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNOT6LQ96LI5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNOT6LQ96LI5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNOT6LQ96LI5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNOT6LQ96LI5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNOT6LQ96LI5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNOT6LQ96LI5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CNOT6LQ96LI5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CNOT6LQ96LI5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNOT6LQ96LI5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNOT6LQ96LI5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNOT6LQ96LI5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNOT6LQ96LI5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CNOT6LQ96LI5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNOT6LQ96LI5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNOT6LQ96LI5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNOT6LQ96LI5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNOT6LQ96LI5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNOT6LQ96LI5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNOT6LQ96LI5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNOT6LQ96LI5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNOT6LQ96LI5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CNOT6LQ96LI5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNOT6LQ96LI5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNOT6LQ96LI5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNOT6LQ96LI5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNOT6LQ96LI5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CNOT6LQ96LI5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNOT6LQ96LI5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNOT6LQ96LI5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNOT6LQ96LI5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CNOT6LQ96LI5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNOT6LQ96LI5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNOT6LQ96LI5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNOT6LQ96LI5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms