Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SERAC1Q96JX3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SERAC1Q96JX3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SERAC1Q96JX3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SERAC1Q96JX3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SERAC1Q96JX3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SERAC1Q96JX3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SERAC1Q96JX3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SERAC1Q96JX3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SERAC1Q96JX3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SERAC1Q96JX3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SERAC1Q96JX3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SERAC1Q96JX3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SERAC1Q96JX3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SERAC1Q96JX3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SERAC1Q96JX3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SERAC1Q96JX3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SERAC1Q96JX3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SERAC1Q96JX3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SERAC1Q96JX3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SERAC1Q96JX3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SERAC1Q96JX3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SERAC1Q96JX3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SERAC1Q96JX3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SERAC1Q96JX3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SERAC1Q96JX3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SERAC1Q96JX3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SERAC1Q96JX3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SERAC1Q96JX3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SERAC1Q96JX3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SERAC1Q96JX3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SERAC1Q96JX3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SERAC1Q96JX3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SERAC1Q96JX3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SERAC1Q96JX3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SERAC1Q96JX3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SERAC1Q96JX3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SERAC1Q96JX3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SERAC1Q96JX3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SERAC1Q96JX3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SERAC1Q96JX3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SERAC1Q96JX3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SERAC1Q96JX3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SERAC1Q96JX3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SERAC1Q96JX3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SERAC1Q96JX3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SERAC1Q96JX3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SERAC1Q96JX3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SERAC1Q96JX3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SERAC1Q96JX3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SERAC1Q96JX3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SERAC1Q96JX3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SERAC1Q96JX3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SERAC1Q96JX3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SERAC1Q96JX3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SERAC1Q96JX3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SERAC1Q96JX3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SERAC1Q96JX3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SERAC1Q96JX3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SERAC1Q96JX3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SERAC1Q96JX3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SERAC1Q96JX3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SERAC1Q96JX3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SERAC1Q96JX3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SERAC1Q96JX3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SERAC1Q96JX3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SERAC1Q96JX3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SERAC1Q96JX3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SERAC1Q96JX3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SERAC1Q96JX3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SERAC1Q96JX3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SERAC1Q96JX3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SERAC1Q96JX3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SERAC1Q96JX3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SERAC1Q96JX3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SERAC1Q96JX3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SERAC1Q96JX3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SERAC1Q96JX3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SERAC1Q96JX3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SERAC1Q96JX3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SERAC1Q96JX3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SERAC1Q96JX3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SERAC1Q96JX3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SERAC1Q96JX3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SERAC1Q96JX3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SERAC1Q96JX3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SERAC1Q96JX3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SERAC1Q96JX3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SERAC1Q96JX3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SERAC1Q96JX3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SERAC1Q96JX3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SERAC1Q96JX3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SERAC1Q96JX3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SERAC1Q96JX3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SERAC1Q96JX3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SERAC1Q96JX3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SERAC1Q96JX3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SERAC1Q96JX3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SERAC1Q96JX3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SERAC1Q96JX3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms