Protein–RNA interactions for Protein: Q96FH0

BORCS8, BLOC-1-related complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS8Q96FH0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BORCS8Q96FH0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BORCS8Q96FH0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BORCS8Q96FH0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BORCS8Q96FH0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BORCS8Q96FH0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BORCS8Q96FH0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BORCS8Q96FH0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BORCS8Q96FH0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BORCS8Q96FH0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BORCS8Q96FH0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS8Q96FH0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS8Q96FH0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BORCS8Q96FH0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BORCS8Q96FH0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BORCS8Q96FH0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BORCS8Q96FH0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BORCS8Q96FH0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BORCS8Q96FH0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BORCS8Q96FH0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BORCS8Q96FH0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BORCS8Q96FH0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BORCS8Q96FH0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BORCS8Q96FH0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BORCS8Q96FH0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BORCS8Q96FH0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BORCS8Q96FH0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BORCS8Q96FH0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BORCS8Q96FH0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BORCS8Q96FH0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BORCS8Q96FH0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BORCS8Q96FH0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BORCS8Q96FH0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BORCS8Q96FH0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BORCS8Q96FH0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BORCS8Q96FH0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BORCS8Q96FH0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BORCS8Q96FH0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BORCS8Q96FH0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BORCS8Q96FH0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BORCS8Q96FH0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BORCS8Q96FH0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BORCS8Q96FH0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BORCS8Q96FH0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BORCS8Q96FH0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BORCS8Q96FH0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BORCS8Q96FH0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BORCS8Q96FH0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BORCS8Q96FH0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BORCS8Q96FH0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BORCS8Q96FH0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BORCS8Q96FH0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BORCS8Q96FH0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BORCS8Q96FH0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BORCS8Q96FH0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BORCS8Q96FH0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BORCS8Q96FH0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BORCS8Q96FH0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BORCS8Q96FH0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BORCS8Q96FH0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BORCS8Q96FH0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BORCS8Q96FH0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BORCS8Q96FH0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BORCS8Q96FH0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BORCS8Q96FH0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BORCS8Q96FH0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BORCS8Q96FH0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BORCS8Q96FH0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BORCS8Q96FH0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BORCS8Q96FH0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BORCS8Q96FH0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BORCS8Q96FH0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BORCS8Q96FH0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BORCS8Q96FH0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BORCS8Q96FH0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BORCS8Q96FH0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BORCS8Q96FH0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BORCS8Q96FH0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BORCS8Q96FH0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BORCS8Q96FH0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BORCS8Q96FH0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BORCS8Q96FH0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BORCS8Q96FH0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BORCS8Q96FH0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BORCS8Q96FH0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BORCS8Q96FH0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BORCS8Q96FH0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BORCS8Q96FH0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BORCS8Q96FH0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BORCS8Q96FH0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BORCS8Q96FH0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BORCS8Q96FH0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BORCS8Q96FH0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BORCS8Q96FH0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BORCS8Q96FH0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BORCS8Q96FH0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BORCS8Q96FH0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BORCS8Q96FH0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BORCS8Q96FH0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BORCS8Q96FH0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms