Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MFSD3Q96ES6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MFSD3Q96ES6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MFSD3Q96ES6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MFSD3Q96ES6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MFSD3Q96ES6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MFSD3Q96ES6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MFSD3Q96ES6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MFSD3Q96ES6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MFSD3Q96ES6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MFSD3Q96ES6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MFSD3Q96ES6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MFSD3Q96ES6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MFSD3Q96ES6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MFSD3Q96ES6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MFSD3Q96ES6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MFSD3Q96ES6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MFSD3Q96ES6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MFSD3Q96ES6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MFSD3Q96ES6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MFSD3Q96ES6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MFSD3Q96ES6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MFSD3Q96ES6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MFSD3Q96ES6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MFSD3Q96ES6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MFSD3Q96ES6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MFSD3Q96ES6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MFSD3Q96ES6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MFSD3Q96ES6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MFSD3Q96ES6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MFSD3Q96ES6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MFSD3Q96ES6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MFSD3Q96ES6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MFSD3Q96ES6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MFSD3Q96ES6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MFSD3Q96ES6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MFSD3Q96ES6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MFSD3Q96ES6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MFSD3Q96ES6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MFSD3Q96ES6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MFSD3Q96ES6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MFSD3Q96ES6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MFSD3Q96ES6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MFSD3Q96ES6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MFSD3Q96ES6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MFSD3Q96ES6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MFSD3Q96ES6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MFSD3Q96ES6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MFSD3Q96ES6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MFSD3Q96ES6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MFSD3Q96ES6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MFSD3Q96ES6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFSD3Q96ES6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MFSD3Q96ES6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MFSD3Q96ES6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MFSD3Q96ES6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MFSD3Q96ES6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MFSD3Q96ES6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MFSD3Q96ES6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MFSD3Q96ES6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MFSD3Q96ES6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MFSD3Q96ES6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MFSD3Q96ES6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MFSD3Q96ES6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MFSD3Q96ES6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MFSD3Q96ES6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MFSD3Q96ES6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MFSD3Q96ES6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MFSD3Q96ES6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MFSD3Q96ES6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MFSD3Q96ES6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MFSD3Q96ES6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MFSD3Q96ES6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MFSD3Q96ES6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MFSD3Q96ES6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MFSD3Q96ES6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MFSD3Q96ES6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MFSD3Q96ES6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MFSD3Q96ES6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MFSD3Q96ES6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MFSD3Q96ES6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MFSD3Q96ES6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MFSD3Q96ES6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MFSD3Q96ES6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MFSD3Q96ES6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MFSD3Q96ES6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MFSD3Q96ES6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MFSD3Q96ES6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MFSD3Q96ES6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MFSD3Q96ES6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MFSD3Q96ES6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MFSD3Q96ES6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MFSD3Q96ES6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MFSD3Q96ES6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MFSD3Q96ES6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MFSD3Q96ES6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MFSD3Q96ES6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MFSD3Q96ES6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MFSD3Q96ES6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MFSD3Q96ES6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms