Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
MFSD3Q96ES6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MFSD3Q96ES6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
MFSD3Q96ES6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
MFSD3Q96ES6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MFSD3Q96ES6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MFSD3Q96ES6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
MFSD3Q96ES6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
MFSD3Q96ES6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MFSD3Q96ES6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
MFSD3Q96ES6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
MFSD3Q96ES6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
MFSD3Q96ES6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MFSD3Q96ES6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
MFSD3Q96ES6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
MFSD3Q96ES6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MFSD3Q96ES6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
MFSD3Q96ES6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
MFSD3Q96ES6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MFSD3Q96ES6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
MFSD3Q96ES6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
MFSD3Q96ES6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
MFSD3Q96ES6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MFSD3Q96ES6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
MFSD3Q96ES6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MFSD3Q96ES6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
MFSD3Q96ES6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
MFSD3Q96ES6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
MFSD3Q96ES6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
MFSD3Q96ES6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MFSD3Q96ES6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MFSD3Q96ES6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MFSD3Q96ES6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MFSD3Q96ES6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MFSD3Q96ES6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MFSD3Q96ES6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
MFSD3Q96ES6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
MFSD3Q96ES6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
MFSD3Q96ES6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MFSD3Q96ES6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MFSD3Q96ES6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MFSD3Q96ES6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
MFSD3Q96ES6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MFSD3Q96ES6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MFSD3Q96ES6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MFSD3Q96ES6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
MFSD3Q96ES6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MFSD3Q96ES6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MFSD3Q96ES6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MFSD3Q96ES6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MFSD3Q96ES6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MFSD3Q96ES6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MFSD3Q96ES6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MFSD3Q96ES6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MFSD3Q96ES6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MFSD3Q96ES6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MFSD3Q96ES6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MFSD3Q96ES6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MFSD3Q96ES6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MFSD3Q96ES6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MFSD3Q96ES6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MFSD3Q96ES6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MFSD3Q96ES6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MFSD3Q96ES6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MFSD3Q96ES6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MFSD3Q96ES6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MFSD3Q96ES6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MFSD3Q96ES6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MFSD3Q96ES6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MFSD3Q96ES6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
MFSD3Q96ES6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MFSD3Q96ES6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MFSD3Q96ES6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
MFSD3Q96ES6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MFSD3Q96ES6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MFSD3Q96ES6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
MFSD3Q96ES6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MFSD3Q96ES6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MFSD3Q96ES6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MFSD3Q96ES6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MFSD3Q96ES6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MFSD3Q96ES6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MFSD3Q96ES6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MFSD3Q96ES6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MFSD3Q96ES6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MFSD3Q96ES6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MFSD3Q96ES6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MFSD3Q96ES6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
MFSD3Q96ES6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MFSD3Q96ES6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MFSD3Q96ES6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MFSD3Q96ES6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MFSD3Q96ES6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
MFSD3Q96ES6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MFSD3Q96ES6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MFSD3Q96ES6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MFSD3Q96ES6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MFSD3Q96ES6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MFSD3Q96ES6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MFSD3Q96ES6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms