Protein–RNA interactions for Protein: Q96BH1

RNF25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF25Q96BH1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF25Q96BH1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF25Q96BH1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF25Q96BH1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF25Q96BH1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF25Q96BH1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF25Q96BH1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF25Q96BH1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF25Q96BH1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF25Q96BH1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF25Q96BH1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RNF25Q96BH1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RNF25Q96BH1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF25Q96BH1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF25Q96BH1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF25Q96BH1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF25Q96BH1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF25Q96BH1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF25Q96BH1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF25Q96BH1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF25Q96BH1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF25Q96BH1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF25Q96BH1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF25Q96BH1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF25Q96BH1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF25Q96BH1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF25Q96BH1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF25Q96BH1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF25Q96BH1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF25Q96BH1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF25Q96BH1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF25Q96BH1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF25Q96BH1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF25Q96BH1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF25Q96BH1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF25Q96BH1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF25Q96BH1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF25Q96BH1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF25Q96BH1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF25Q96BH1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF25Q96BH1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF25Q96BH1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF25Q96BH1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF25Q96BH1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF25Q96BH1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RNF25Q96BH1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RNF25Q96BH1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RNF25Q96BH1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF25Q96BH1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF25Q96BH1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF25Q96BH1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF25Q96BH1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF25Q96BH1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF25Q96BH1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF25Q96BH1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF25Q96BH1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF25Q96BH1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF25Q96BH1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF25Q96BH1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF25Q96BH1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF25Q96BH1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF25Q96BH1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF25Q96BH1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF25Q96BH1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF25Q96BH1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF25Q96BH1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF25Q96BH1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF25Q96BH1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF25Q96BH1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF25Q96BH1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF25Q96BH1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF25Q96BH1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF25Q96BH1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF25Q96BH1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF25Q96BH1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF25Q96BH1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF25Q96BH1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF25Q96BH1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF25Q96BH1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF25Q96BH1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF25Q96BH1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF25Q96BH1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF25Q96BH1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF25Q96BH1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF25Q96BH1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF25Q96BH1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF25Q96BH1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF25Q96BH1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF25Q96BH1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF25Q96BH1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF25Q96BH1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF25Q96BH1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF25Q96BH1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF25Q96BH1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF25Q96BH1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF25Q96BH1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF25Q96BH1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF25Q96BH1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF25Q96BH1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF25Q96BH1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms