Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC47Q96A33 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC47Q96A33 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC47Q96A33 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC47Q96A33 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC47Q96A33 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC47Q96A33 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC47Q96A33 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC47Q96A33 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC47Q96A33 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC47Q96A33 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC47Q96A33 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC47Q96A33 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC47Q96A33 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC47Q96A33 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC47Q96A33 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC47Q96A33 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC47Q96A33 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC47Q96A33 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC47Q96A33 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC47Q96A33 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC47Q96A33 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC47Q96A33 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC47Q96A33 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC47Q96A33 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC47Q96A33 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC47Q96A33 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC47Q96A33 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC47Q96A33 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC47Q96A33 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC47Q96A33 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC47Q96A33 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC47Q96A33 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC47Q96A33 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC47Q96A33 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC47Q96A33 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC47Q96A33 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC47Q96A33 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC47Q96A33 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC47Q96A33 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC47Q96A33 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC47Q96A33 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC47Q96A33 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC47Q96A33 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC47Q96A33 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC47Q96A33 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC47Q96A33 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC47Q96A33 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC47Q96A33 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC47Q96A33 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC47Q96A33 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC47Q96A33 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC47Q96A33 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC47Q96A33 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC47Q96A33 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC47Q96A33 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC47Q96A33 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC47Q96A33 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC47Q96A33 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC47Q96A33 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC47Q96A33 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC47Q96A33 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC47Q96A33 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC47Q96A33 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC47Q96A33 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC47Q96A33 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC47Q96A33 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC47Q96A33 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC47Q96A33 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC47Q96A33 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC47Q96A33 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC47Q96A33 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.4 ms