Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP6V1E2Q96A05 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP6V1E2Q96A05 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP6V1E2Q96A05 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP6V1E2Q96A05 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP6V1E2Q96A05 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP6V1E2Q96A05 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP6V1E2Q96A05 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP6V1E2Q96A05 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP6V1E2Q96A05 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP6V1E2Q96A05 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP6V1E2Q96A05 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP6V1E2Q96A05 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP6V1E2Q96A05 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP6V1E2Q96A05 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP6V1E2Q96A05 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP6V1E2Q96A05 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP6V1E2Q96A05 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP6V1E2Q96A05 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP6V1E2Q96A05 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP6V1E2Q96A05 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP6V1E2Q96A05 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP6V1E2Q96A05 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP6V1E2Q96A05 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP6V1E2Q96A05 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP6V1E2Q96A05 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP6V1E2Q96A05 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP6V1E2Q96A05 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP6V1E2Q96A05 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP6V1E2Q96A05 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP6V1E2Q96A05 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP6V1E2Q96A05 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP6V1E2Q96A05 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP6V1E2Q96A05 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP6V1E2Q96A05 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP6V1E2Q96A05 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP6V1E2Q96A05 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP6V1E2Q96A05 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP6V1E2Q96A05 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP6V1E2Q96A05 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP6V1E2Q96A05 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP6V1E2Q96A05 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP6V1E2Q96A05 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP6V1E2Q96A05 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP6V1E2Q96A05 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP6V1E2Q96A05 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP6V1E2Q96A05 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP6V1E2Q96A05 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP6V1E2Q96A05 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP6V1E2Q96A05 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP6V1E2Q96A05 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP6V1E2Q96A05 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP6V1E2Q96A05 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP6V1E2Q96A05 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP6V1E2Q96A05 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP6V1E2Q96A05 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP6V1E2Q96A05 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP6V1E2Q96A05 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP6V1E2Q96A05 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP6V1E2Q96A05 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP6V1E2Q96A05 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP6V1E2Q96A05 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP6V1E2Q96A05 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP6V1E2Q96A05 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP6V1E2Q96A05 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP6V1E2Q96A05 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP6V1E2Q96A05 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP6V1E2Q96A05 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP6V1E2Q96A05 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP6V1E2Q96A05 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATP6V1E2Q96A05 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP6V1E2Q96A05 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP6V1E2Q96A05 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP6V1E2Q96A05 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP6V1E2Q96A05 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP6V1E2Q96A05 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP6V1E2Q96A05 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP6V1E2Q96A05 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP6V1E2Q96A05 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP6V1E2Q96A05 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP6V1E2Q96A05 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP6V1E2Q96A05 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP6V1E2Q96A05 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP6V1E2Q96A05 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP6V1E2Q96A05 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP6V1E2Q96A05 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP6V1E2Q96A05 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP6V1E2Q96A05 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP6V1E2Q96A05 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP6V1E2Q96A05 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP6V1E2Q96A05 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP6V1E2Q96A05 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP6V1E2Q96A05 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP6V1E2Q96A05 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP6V1E2Q96A05 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP6V1E2Q96A05 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP6V1E2Q96A05 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP6V1E2Q96A05 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP6V1E2Q96A05 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP6V1E2Q96A05 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms