Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ATP6V1E2Q96A05 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP6V1E2Q96A05 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ATP6V1E2Q96A05 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
ATP6V1E2Q96A05 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATP6V1E2Q96A05 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ATP6V1E2Q96A05 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ATP6V1E2Q96A05 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ATP6V1E2Q96A05 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ATP6V1E2Q96A05 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ATP6V1E2Q96A05 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ATP6V1E2Q96A05 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ATP6V1E2Q96A05 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ATP6V1E2Q96A05 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATP6V1E2Q96A05 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATP6V1E2Q96A05 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATP6V1E2Q96A05 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATP6V1E2Q96A05 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATP6V1E2Q96A05 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATP6V1E2Q96A05 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATP6V1E2Q96A05 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATP6V1E2Q96A05 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATP6V1E2Q96A05 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATP6V1E2Q96A05 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ATP6V1E2Q96A05 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP6V1E2Q96A05 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP6V1E2Q96A05 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP6V1E2Q96A05 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP6V1E2Q96A05 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP6V1E2Q96A05 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP6V1E2Q96A05 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP6V1E2Q96A05 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP6V1E2Q96A05 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP6V1E2Q96A05 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP6V1E2Q96A05 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP6V1E2Q96A05 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATP6V1E2Q96A05 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATP6V1E2Q96A05 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP6V1E2Q96A05 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP6V1E2Q96A05 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP6V1E2Q96A05 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP6V1E2Q96A05 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP6V1E2Q96A05 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP6V1E2Q96A05 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP6V1E2Q96A05 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP6V1E2Q96A05 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP6V1E2Q96A05 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP6V1E2Q96A05 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP6V1E2Q96A05 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP6V1E2Q96A05 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP6V1E2Q96A05 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP6V1E2Q96A05 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP6V1E2Q96A05 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP6V1E2Q96A05 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP6V1E2Q96A05 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATP6V1E2Q96A05 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP6V1E2Q96A05 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP6V1E2Q96A05 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP6V1E2Q96A05 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP6V1E2Q96A05 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP6V1E2Q96A05 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP6V1E2Q96A05 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP6V1E2Q96A05 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP6V1E2Q96A05 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP6V1E2Q96A05 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP6V1E2Q96A05 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP6V1E2Q96A05 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP6V1E2Q96A05 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP6V1E2Q96A05 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP6V1E2Q96A05 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP6V1E2Q96A05 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP6V1E2Q96A05 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP6V1E2Q96A05 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP6V1E2Q96A05 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP6V1E2Q96A05 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP6V1E2Q96A05 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP6V1E2Q96A05 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP6V1E2Q96A05 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP6V1E2Q96A05 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP6V1E2Q96A05 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP6V1E2Q96A05 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP6V1E2Q96A05 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP6V1E2Q96A05 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP6V1E2Q96A05 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP6V1E2Q96A05 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP6V1E2Q96A05 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP6V1E2Q96A05 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP6V1E2Q96A05 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP6V1E2Q96A05 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP6V1E2Q96A05 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP6V1E2Q96A05 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP6V1E2Q96A05 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP6V1E2Q96A05 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATP6V1E2Q96A05 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP6V1E2Q96A05 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP6V1E2Q96A05 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP6V1E2Q96A05 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP6V1E2Q96A05 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP6V1E2Q96A05 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP6V1E2Q96A05 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms