Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX4Q969G2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX4Q969G2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LHX4Q969G2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX4Q969G2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX4Q969G2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX4Q969G2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX4Q969G2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX4Q969G2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX4Q969G2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX4Q969G2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX4Q969G2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX4Q969G2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX4Q969G2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX4Q969G2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX4Q969G2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX4Q969G2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX4Q969G2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX4Q969G2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX4Q969G2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX4Q969G2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX4Q969G2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX4Q969G2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX4Q969G2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHX4Q969G2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHX4Q969G2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHX4Q969G2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX4Q969G2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX4Q969G2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX4Q969G2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHX4Q969G2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX4Q969G2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LHX4Q969G2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LHX4Q969G2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX4Q969G2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHX4Q969G2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX4Q969G2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX4Q969G2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX4Q969G2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHX4Q969G2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX4Q969G2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LHX4Q969G2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX4Q969G2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX4Q969G2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX4Q969G2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX4Q969G2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX4Q969G2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX4Q969G2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LHX4Q969G2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX4Q969G2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX4Q969G2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX4Q969G2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX4Q969G2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LHX4Q969G2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX4Q969G2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LHX4Q969G2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LHX4Q969G2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX4Q969G2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX4Q969G2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX4Q969G2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX4Q969G2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX4Q969G2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX4Q969G2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX4Q969G2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX4Q969G2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX4Q969G2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX4Q969G2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX4Q969G2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX4Q969G2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX4Q969G2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX4Q969G2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX4Q969G2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX4Q969G2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX4Q969G2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX4Q969G2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX4Q969G2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX4Q969G2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX4Q969G2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX4Q969G2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX4Q969G2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX4Q969G2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX4Q969G2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX4Q969G2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX4Q969G2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX4Q969G2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX4Q969G2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX4Q969G2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX4Q969G2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX4Q969G2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX4Q969G2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX4Q969G2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX4Q969G2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX4Q969G2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX4Q969G2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX4Q969G2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX4Q969G2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX4Q969G2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX4Q969G2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX4Q969G2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX4Q969G2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms