Protein–RNA interactions for Protein: Q92621

NUP205, Nuclear pore complex protein Nup205, humanhuman

Predictions only

Length 2,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP205Q92621 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP205Q92621 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP205Q92621 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP205Q92621 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP205Q92621 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP205Q92621 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP205Q92621 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP205Q92621 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP205Q92621 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP205Q92621 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP205Q92621 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP205Q92621 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP205Q92621 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP205Q92621 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP205Q92621 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NUP205Q92621 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NUP205Q92621 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP205Q92621 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP205Q92621 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP205Q92621 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP205Q92621 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP205Q92621 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP205Q92621 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP205Q92621 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP205Q92621 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP205Q92621 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP205Q92621 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP205Q92621 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP205Q92621 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP205Q92621 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP205Q92621 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP205Q92621 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP205Q92621 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP205Q92621 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP205Q92621 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP205Q92621 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP205Q92621 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP205Q92621 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP205Q92621 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP205Q92621 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUP205Q92621 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUP205Q92621 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP205Q92621 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUP205Q92621 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP205Q92621 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP205Q92621 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP205Q92621 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP205Q92621 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP205Q92621 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP205Q92621 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP205Q92621 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP205Q92621 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP205Q92621 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP205Q92621 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP205Q92621 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP205Q92621 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP205Q92621 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP205Q92621 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP205Q92621 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP205Q92621 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP205Q92621 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP205Q92621 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP205Q92621 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP205Q92621 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP205Q92621 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP205Q92621 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP205Q92621 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP205Q92621 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP205Q92621 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP205Q92621 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP205Q92621 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP205Q92621 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP205Q92621 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP205Q92621 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP205Q92621 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP205Q92621 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP205Q92621 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP205Q92621 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP205Q92621 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP205Q92621 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP205Q92621 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP205Q92621 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP205Q92621 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP205Q92621 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP205Q92621 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP205Q92621 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP205Q92621 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP205Q92621 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP205Q92621 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP205Q92621 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP205Q92621 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP205Q92621 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP205Q92621 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP205Q92621 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP205Q92621 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP205Q92621 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP205Q92621 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP205Q92621 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP205Q92621 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP205Q92621 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms