Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF128Q8TEB7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF128Q8TEB7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF128Q8TEB7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF128Q8TEB7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF128Q8TEB7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF128Q8TEB7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF128Q8TEB7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF128Q8TEB7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF128Q8TEB7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF128Q8TEB7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF128Q8TEB7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF128Q8TEB7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF128Q8TEB7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF128Q8TEB7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF128Q8TEB7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF128Q8TEB7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF128Q8TEB7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF128Q8TEB7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF128Q8TEB7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF128Q8TEB7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF128Q8TEB7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF128Q8TEB7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF128Q8TEB7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF128Q8TEB7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF128Q8TEB7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF128Q8TEB7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF128Q8TEB7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF128Q8TEB7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF128Q8TEB7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF128Q8TEB7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF128Q8TEB7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF128Q8TEB7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF128Q8TEB7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF128Q8TEB7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF128Q8TEB7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF128Q8TEB7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF128Q8TEB7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF128Q8TEB7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF128Q8TEB7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF128Q8TEB7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF128Q8TEB7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF128Q8TEB7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF128Q8TEB7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF128Q8TEB7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF128Q8TEB7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF128Q8TEB7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF128Q8TEB7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF128Q8TEB7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF128Q8TEB7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF128Q8TEB7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF128Q8TEB7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF128Q8TEB7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF128Q8TEB7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF128Q8TEB7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF128Q8TEB7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF128Q8TEB7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF128Q8TEB7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF128Q8TEB7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF128Q8TEB7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF128Q8TEB7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF128Q8TEB7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF128Q8TEB7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF128Q8TEB7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF128Q8TEB7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF128Q8TEB7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF128Q8TEB7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF128Q8TEB7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF128Q8TEB7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF128Q8TEB7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF128Q8TEB7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF128Q8TEB7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF128Q8TEB7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF128Q8TEB7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF128Q8TEB7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF128Q8TEB7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF128Q8TEB7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF128Q8TEB7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF128Q8TEB7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF128Q8TEB7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF128Q8TEB7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF128Q8TEB7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF128Q8TEB7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF128Q8TEB7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF128Q8TEB7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF128Q8TEB7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF128Q8TEB7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF128Q8TEB7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF128Q8TEB7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF128Q8TEB7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF128Q8TEB7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF128Q8TEB7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF128Q8TEB7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF128Q8TEB7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF128Q8TEB7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF128Q8TEB7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF128Q8TEB7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF128Q8TEB7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF128Q8TEB7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF128Q8TEB7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms