Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VN1R17PQ8TDU5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VN1R17PQ8TDU5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VN1R17PQ8TDU5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VN1R17PQ8TDU5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VN1R17PQ8TDU5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VN1R17PQ8TDU5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VN1R17PQ8TDU5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R17PQ8TDU5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R17PQ8TDU5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R17PQ8TDU5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R17PQ8TDU5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R17PQ8TDU5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R17PQ8TDU5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VN1R17PQ8TDU5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VN1R17PQ8TDU5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VN1R17PQ8TDU5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R17PQ8TDU5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R17PQ8TDU5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R17PQ8TDU5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VN1R17PQ8TDU5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VN1R17PQ8TDU5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R17PQ8TDU5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R17PQ8TDU5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R17PQ8TDU5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VN1R17PQ8TDU5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VN1R17PQ8TDU5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VN1R17PQ8TDU5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VN1R17PQ8TDU5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VN1R17PQ8TDU5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
VN1R17PQ8TDU5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VN1R17PQ8TDU5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VN1R17PQ8TDU5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VN1R17PQ8TDU5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VN1R17PQ8TDU5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VN1R17PQ8TDU5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VN1R17PQ8TDU5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VN1R17PQ8TDU5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VN1R17PQ8TDU5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VN1R17PQ8TDU5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VN1R17PQ8TDU5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VN1R17PQ8TDU5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VN1R17PQ8TDU5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VN1R17PQ8TDU5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VN1R17PQ8TDU5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VN1R17PQ8TDU5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VN1R17PQ8TDU5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VN1R17PQ8TDU5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VN1R17PQ8TDU5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VN1R17PQ8TDU5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VN1R17PQ8TDU5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VN1R17PQ8TDU5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VN1R17PQ8TDU5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VN1R17PQ8TDU5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VN1R17PQ8TDU5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VN1R17PQ8TDU5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VN1R17PQ8TDU5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VN1R17PQ8TDU5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VN1R17PQ8TDU5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VN1R17PQ8TDU5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VN1R17PQ8TDU5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VN1R17PQ8TDU5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VN1R17PQ8TDU5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VN1R17PQ8TDU5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VN1R17PQ8TDU5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VN1R17PQ8TDU5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VN1R17PQ8TDU5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VN1R17PQ8TDU5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VN1R17PQ8TDU5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VN1R17PQ8TDU5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VN1R17PQ8TDU5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VN1R17PQ8TDU5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VN1R17PQ8TDU5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VN1R17PQ8TDU5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R17PQ8TDU5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R17PQ8TDU5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R17PQ8TDU5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VN1R17PQ8TDU5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VN1R17PQ8TDU5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VN1R17PQ8TDU5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VN1R17PQ8TDU5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VN1R17PQ8TDU5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VN1R17PQ8TDU5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VN1R17PQ8TDU5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
VN1R17PQ8TDU5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
VN1R17PQ8TDU5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VN1R17PQ8TDU5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VN1R17PQ8TDU5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VN1R17PQ8TDU5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VN1R17PQ8TDU5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21■□□□□ 0.95
VN1R17PQ8TDU5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VN1R17PQ8TDU5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R17PQ8TDU5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VN1R17PQ8TDU5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VN1R17PQ8TDU5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VN1R17PQ8TDU5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VN1R17PQ8TDU5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VN1R17PQ8TDU5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VN1R17PQ8TDU5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VN1R17PQ8TDU5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms