Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD22

SFXN5, Sideroflexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN5Q8TD22 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SFXN5Q8TD22 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFXN5Q8TD22 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFXN5Q8TD22 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFXN5Q8TD22 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFXN5Q8TD22 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFXN5Q8TD22 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SFXN5Q8TD22 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFXN5Q8TD22 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFXN5Q8TD22 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFXN5Q8TD22 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFXN5Q8TD22 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFXN5Q8TD22 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFXN5Q8TD22 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFXN5Q8TD22 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFXN5Q8TD22 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFXN5Q8TD22 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFXN5Q8TD22 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFXN5Q8TD22 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFXN5Q8TD22 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFXN5Q8TD22 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFXN5Q8TD22 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFXN5Q8TD22 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFXN5Q8TD22 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFXN5Q8TD22 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFXN5Q8TD22 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFXN5Q8TD22 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFXN5Q8TD22 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFXN5Q8TD22 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFXN5Q8TD22 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFXN5Q8TD22 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFXN5Q8TD22 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFXN5Q8TD22 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFXN5Q8TD22 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFXN5Q8TD22 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SFXN5Q8TD22 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFXN5Q8TD22 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SFXN5Q8TD22 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFXN5Q8TD22 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFXN5Q8TD22 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFXN5Q8TD22 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFXN5Q8TD22 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFXN5Q8TD22 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SFXN5Q8TD22 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFXN5Q8TD22 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFXN5Q8TD22 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFXN5Q8TD22 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFXN5Q8TD22 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFXN5Q8TD22 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFXN5Q8TD22 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFXN5Q8TD22 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SFXN5Q8TD22 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFXN5Q8TD22 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFXN5Q8TD22 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFXN5Q8TD22 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFXN5Q8TD22 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFXN5Q8TD22 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFXN5Q8TD22 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SFXN5Q8TD22 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFXN5Q8TD22 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFXN5Q8TD22 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SFXN5Q8TD22 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFXN5Q8TD22 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFXN5Q8TD22 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFXN5Q8TD22 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFXN5Q8TD22 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFXN5Q8TD22 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFXN5Q8TD22 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFXN5Q8TD22 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFXN5Q8TD22 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFXN5Q8TD22 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFXN5Q8TD22 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFXN5Q8TD22 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFXN5Q8TD22 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SFXN5Q8TD22 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFXN5Q8TD22 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFXN5Q8TD22 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFXN5Q8TD22 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFXN5Q8TD22 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFXN5Q8TD22 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SFXN5Q8TD22 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFXN5Q8TD22 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SFXN5Q8TD22 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFXN5Q8TD22 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFXN5Q8TD22 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFXN5Q8TD22 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFXN5Q8TD22 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFXN5Q8TD22 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFXN5Q8TD22 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFXN5Q8TD22 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SFXN5Q8TD22 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFXN5Q8TD22 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SFXN5Q8TD22 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFXN5Q8TD22 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFXN5Q8TD22 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFXN5Q8TD22 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFXN5Q8TD22 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFXN5Q8TD22 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SFXN5Q8TD22 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFXN5Q8TD22 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms