Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAM71BQ8TC56 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAM71BQ8TC56 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAM71BQ8TC56 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAM71BQ8TC56 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAM71BQ8TC56 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAM71BQ8TC56 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FAM71BQ8TC56 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FAM71BQ8TC56 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FAM71BQ8TC56 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FAM71BQ8TC56 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM71BQ8TC56 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM71BQ8TC56 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAM71BQ8TC56 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FAM71BQ8TC56 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
FAM71BQ8TC56 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FAM71BQ8TC56 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM71BQ8TC56 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAM71BQ8TC56 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM71BQ8TC56 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAM71BQ8TC56 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAM71BQ8TC56 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM71BQ8TC56 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAM71BQ8TC56 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM71BQ8TC56 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM71BQ8TC56 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAM71BQ8TC56 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FAM71BQ8TC56 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FAM71BQ8TC56 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FAM71BQ8TC56 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FAM71BQ8TC56 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM71BQ8TC56 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM71BQ8TC56 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM71BQ8TC56 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM71BQ8TC56 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM71BQ8TC56 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM71BQ8TC56 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM71BQ8TC56 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM71BQ8TC56 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM71BQ8TC56 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM71BQ8TC56 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FAM71BQ8TC56 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAM71BQ8TC56 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAM71BQ8TC56 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAM71BQ8TC56 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAM71BQ8TC56 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FAM71BQ8TC56 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAM71BQ8TC56 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAM71BQ8TC56 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAM71BQ8TC56 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FAM71BQ8TC56 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM71BQ8TC56 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM71BQ8TC56 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FAM71BQ8TC56 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FAM71BQ8TC56 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FAM71BQ8TC56 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FAM71BQ8TC56 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FAM71BQ8TC56 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FAM71BQ8TC56 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FAM71BQ8TC56 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM71BQ8TC56 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM71BQ8TC56 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM71BQ8TC56 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM71BQ8TC56 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FAM71BQ8TC56 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM71BQ8TC56 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM71BQ8TC56 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM71BQ8TC56 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM71BQ8TC56 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM71BQ8TC56 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM71BQ8TC56 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM71BQ8TC56 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM71BQ8TC56 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM71BQ8TC56 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM71BQ8TC56 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM71BQ8TC56 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM71BQ8TC56 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM71BQ8TC56 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM71BQ8TC56 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM71BQ8TC56 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM71BQ8TC56 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM71BQ8TC56 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM71BQ8TC56 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM71BQ8TC56 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM71BQ8TC56 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM71BQ8TC56 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM71BQ8TC56 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM71BQ8TC56 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM71BQ8TC56 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM71BQ8TC56 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM71BQ8TC56 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM71BQ8TC56 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM71BQ8TC56 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM71BQ8TC56 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM71BQ8TC56 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM71BQ8TC56 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM71BQ8TC56 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM71BQ8TC56 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM71BQ8TC56 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM71BQ8TC56 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms