Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC110Q8TBZ0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC110Q8TBZ0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC110Q8TBZ0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC110Q8TBZ0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC110Q8TBZ0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC110Q8TBZ0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC110Q8TBZ0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC110Q8TBZ0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC110Q8TBZ0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC110Q8TBZ0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC110Q8TBZ0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC110Q8TBZ0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC110Q8TBZ0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC110Q8TBZ0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC110Q8TBZ0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC110Q8TBZ0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC110Q8TBZ0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC110Q8TBZ0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC110Q8TBZ0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC110Q8TBZ0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC110Q8TBZ0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC110Q8TBZ0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC110Q8TBZ0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC110Q8TBZ0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC110Q8TBZ0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC110Q8TBZ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC110Q8TBZ0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC110Q8TBZ0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC110Q8TBZ0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC110Q8TBZ0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC110Q8TBZ0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC110Q8TBZ0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC110Q8TBZ0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC110Q8TBZ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC110Q8TBZ0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC110Q8TBZ0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC110Q8TBZ0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC110Q8TBZ0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC110Q8TBZ0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC110Q8TBZ0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC110Q8TBZ0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC110Q8TBZ0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC110Q8TBZ0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC110Q8TBZ0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC110Q8TBZ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC110Q8TBZ0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC110Q8TBZ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC110Q8TBZ0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC110Q8TBZ0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC110Q8TBZ0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC110Q8TBZ0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC110Q8TBZ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC110Q8TBZ0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC110Q8TBZ0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC110Q8TBZ0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC110Q8TBZ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC110Q8TBZ0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC110Q8TBZ0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC110Q8TBZ0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC110Q8TBZ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC110Q8TBZ0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC110Q8TBZ0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC110Q8TBZ0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC110Q8TBZ0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC110Q8TBZ0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC110Q8TBZ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC110Q8TBZ0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC110Q8TBZ0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC110Q8TBZ0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC110Q8TBZ0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC110Q8TBZ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC110Q8TBZ0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC110Q8TBZ0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC110Q8TBZ0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC110Q8TBZ0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC110Q8TBZ0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC110Q8TBZ0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC110Q8TBZ0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC110Q8TBZ0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC110Q8TBZ0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC110Q8TBZ0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC110Q8TBZ0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC110Q8TBZ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC110Q8TBZ0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC110Q8TBZ0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC110Q8TBZ0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC110Q8TBZ0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC110Q8TBZ0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC110Q8TBZ0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC110Q8TBZ0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC110Q8TBZ0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC110Q8TBZ0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC110Q8TBZ0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC110Q8TBZ0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC110Q8TBZ0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC110Q8TBZ0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC110Q8TBZ0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC110Q8TBZ0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC110Q8TBZ0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms