Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR5

CIRBP-AS1, Putative uncharacterized protein CIRBP-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-AS1Q8TBR5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIRBP-AS1Q8TBR5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CIRBP-AS1Q8TBR5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIRBP-AS1Q8TBR5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIRBP-AS1Q8TBR5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIRBP-AS1Q8TBR5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIRBP-AS1Q8TBR5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIRBP-AS1Q8TBR5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIRBP-AS1Q8TBR5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CIRBP-AS1Q8TBR5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CIRBP-AS1Q8TBR5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CIRBP-AS1Q8TBR5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIRBP-AS1Q8TBR5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CIRBP-AS1Q8TBR5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIRBP-AS1Q8TBR5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIRBP-AS1Q8TBR5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIRBP-AS1Q8TBR5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIRBP-AS1Q8TBR5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIRBP-AS1Q8TBR5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIRBP-AS1Q8TBR5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIRBP-AS1Q8TBR5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIRBP-AS1Q8TBR5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CIRBP-AS1Q8TBR5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CIRBP-AS1Q8TBR5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CIRBP-AS1Q8TBR5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CIRBP-AS1Q8TBR5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CIRBP-AS1Q8TBR5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIRBP-AS1Q8TBR5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIRBP-AS1Q8TBR5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIRBP-AS1Q8TBR5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIRBP-AS1Q8TBR5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIRBP-AS1Q8TBR5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIRBP-AS1Q8TBR5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIRBP-AS1Q8TBR5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIRBP-AS1Q8TBR5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIRBP-AS1Q8TBR5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIRBP-AS1Q8TBR5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIRBP-AS1Q8TBR5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIRBP-AS1Q8TBR5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIRBP-AS1Q8TBR5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIRBP-AS1Q8TBR5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIRBP-AS1Q8TBR5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIRBP-AS1Q8TBR5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIRBP-AS1Q8TBR5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIRBP-AS1Q8TBR5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIRBP-AS1Q8TBR5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIRBP-AS1Q8TBR5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIRBP-AS1Q8TBR5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIRBP-AS1Q8TBR5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIRBP-AS1Q8TBR5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIRBP-AS1Q8TBR5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIRBP-AS1Q8TBR5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIRBP-AS1Q8TBR5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CIRBP-AS1Q8TBR5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIRBP-AS1Q8TBR5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIRBP-AS1Q8TBR5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIRBP-AS1Q8TBR5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIRBP-AS1Q8TBR5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIRBP-AS1Q8TBR5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIRBP-AS1Q8TBR5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIRBP-AS1Q8TBR5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIRBP-AS1Q8TBR5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIRBP-AS1Q8TBR5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIRBP-AS1Q8TBR5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIRBP-AS1Q8TBR5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIRBP-AS1Q8TBR5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIRBP-AS1Q8TBR5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIRBP-AS1Q8TBR5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIRBP-AS1Q8TBR5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIRBP-AS1Q8TBR5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIRBP-AS1Q8TBR5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIRBP-AS1Q8TBR5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIRBP-AS1Q8TBR5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIRBP-AS1Q8TBR5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIRBP-AS1Q8TBR5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIRBP-AS1Q8TBR5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIRBP-AS1Q8TBR5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CIRBP-AS1Q8TBR5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIRBP-AS1Q8TBR5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIRBP-AS1Q8TBR5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIRBP-AS1Q8TBR5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIRBP-AS1Q8TBR5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIRBP-AS1Q8TBR5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIRBP-AS1Q8TBR5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIRBP-AS1Q8TBR5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CIRBP-AS1Q8TBR5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIRBP-AS1Q8TBR5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CIRBP-AS1Q8TBR5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIRBP-AS1Q8TBR5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIRBP-AS1Q8TBR5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIRBP-AS1Q8TBR5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CIRBP-AS1Q8TBR5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CIRBP-AS1Q8TBR5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms