Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDX1

PSD4, PH and SEC7 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD4Q8NDX1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSD4Q8NDX1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PSD4Q8NDX1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSD4Q8NDX1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSD4Q8NDX1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSD4Q8NDX1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSD4Q8NDX1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSD4Q8NDX1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSD4Q8NDX1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSD4Q8NDX1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSD4Q8NDX1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSD4Q8NDX1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSD4Q8NDX1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSD4Q8NDX1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSD4Q8NDX1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PSD4Q8NDX1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSD4Q8NDX1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSD4Q8NDX1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSD4Q8NDX1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSD4Q8NDX1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSD4Q8NDX1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSD4Q8NDX1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSD4Q8NDX1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSD4Q8NDX1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSD4Q8NDX1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSD4Q8NDX1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSD4Q8NDX1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSD4Q8NDX1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSD4Q8NDX1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSD4Q8NDX1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSD4Q8NDX1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSD4Q8NDX1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSD4Q8NDX1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSD4Q8NDX1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSD4Q8NDX1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PSD4Q8NDX1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSD4Q8NDX1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSD4Q8NDX1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSD4Q8NDX1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSD4Q8NDX1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSD4Q8NDX1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSD4Q8NDX1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSD4Q8NDX1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSD4Q8NDX1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSD4Q8NDX1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSD4Q8NDX1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSD4Q8NDX1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSD4Q8NDX1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSD4Q8NDX1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSD4Q8NDX1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSD4Q8NDX1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSD4Q8NDX1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSD4Q8NDX1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSD4Q8NDX1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSD4Q8NDX1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSD4Q8NDX1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSD4Q8NDX1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSD4Q8NDX1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSD4Q8NDX1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSD4Q8NDX1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSD4Q8NDX1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSD4Q8NDX1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSD4Q8NDX1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSD4Q8NDX1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PSD4Q8NDX1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSD4Q8NDX1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PSD4Q8NDX1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSD4Q8NDX1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSD4Q8NDX1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSD4Q8NDX1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSD4Q8NDX1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PSD4Q8NDX1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSD4Q8NDX1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSD4Q8NDX1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PSD4Q8NDX1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSD4Q8NDX1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSD4Q8NDX1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSD4Q8NDX1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSD4Q8NDX1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSD4Q8NDX1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSD4Q8NDX1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSD4Q8NDX1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSD4Q8NDX1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSD4Q8NDX1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PSD4Q8NDX1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSD4Q8NDX1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSD4Q8NDX1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSD4Q8NDX1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSD4Q8NDX1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSD4Q8NDX1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSD4Q8NDX1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSD4Q8NDX1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSD4Q8NDX1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSD4Q8NDX1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSD4Q8NDX1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSD4Q8NDX1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSD4Q8NDX1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSD4Q8NDX1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSD4Q8NDX1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSD4Q8NDX1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms