Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDX1

PSD4, PH and SEC7 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD4Q8NDX1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PSD4Q8NDX1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PSD4Q8NDX1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PSD4Q8NDX1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PSD4Q8NDX1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PSD4Q8NDX1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PSD4Q8NDX1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
PSD4Q8NDX1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSD4Q8NDX1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSD4Q8NDX1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PSD4Q8NDX1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSD4Q8NDX1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSD4Q8NDX1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSD4Q8NDX1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSD4Q8NDX1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSD4Q8NDX1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSD4Q8NDX1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSD4Q8NDX1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSD4Q8NDX1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSD4Q8NDX1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSD4Q8NDX1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSD4Q8NDX1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSD4Q8NDX1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSD4Q8NDX1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSD4Q8NDX1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSD4Q8NDX1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSD4Q8NDX1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSD4Q8NDX1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSD4Q8NDX1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSD4Q8NDX1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSD4Q8NDX1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSD4Q8NDX1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSD4Q8NDX1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSD4Q8NDX1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSD4Q8NDX1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSD4Q8NDX1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PSD4Q8NDX1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSD4Q8NDX1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSD4Q8NDX1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSD4Q8NDX1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSD4Q8NDX1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSD4Q8NDX1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSD4Q8NDX1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSD4Q8NDX1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSD4Q8NDX1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSD4Q8NDX1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSD4Q8NDX1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSD4Q8NDX1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSD4Q8NDX1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSD4Q8NDX1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSD4Q8NDX1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PSD4Q8NDX1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSD4Q8NDX1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSD4Q8NDX1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSD4Q8NDX1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSD4Q8NDX1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSD4Q8NDX1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSD4Q8NDX1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSD4Q8NDX1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSD4Q8NDX1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PSD4Q8NDX1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSD4Q8NDX1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSD4Q8NDX1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PSD4Q8NDX1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PSD4Q8NDX1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PSD4Q8NDX1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSD4Q8NDX1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSD4Q8NDX1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSD4Q8NDX1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSD4Q8NDX1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSD4Q8NDX1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSD4Q8NDX1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSD4Q8NDX1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSD4Q8NDX1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSD4Q8NDX1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSD4Q8NDX1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSD4Q8NDX1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSD4Q8NDX1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSD4Q8NDX1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSD4Q8NDX1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSD4Q8NDX1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSD4Q8NDX1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSD4Q8NDX1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSD4Q8NDX1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSD4Q8NDX1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSD4Q8NDX1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSD4Q8NDX1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSD4Q8NDX1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSD4Q8NDX1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSD4Q8NDX1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSD4Q8NDX1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSD4Q8NDX1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PSD4Q8NDX1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSD4Q8NDX1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSD4Q8NDX1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSD4Q8NDX1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSD4Q8NDX1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSD4Q8NDX1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSD4Q8NDX1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSD4Q8NDX1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms