Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9G6

Putative UPF0607 protein FLJ37424, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N9G6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q8N9G6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q8N9G6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q8N9G6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Q8N9G6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q8N9G6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q8N9G6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Q8N9G6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Q8N9G6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Q8N9G6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q8N9G6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q8N9G6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q8N9G6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Q8N9G6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Q8N9G6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Q8N9G6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q8N9G6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q8N9G6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q8N9G6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q8N9G6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q8N9G6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q8N9G6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q8N9G6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q8N9G6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q8N9G6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q8N9G6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q8N9G6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q8N9G6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Q8N9G6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Q8N9G6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q8N9G6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Q8N9G6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q8N9G6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q8N9G6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q8N9G6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q8N9G6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Q8N9G6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q8N9G6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q8N9G6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q8N9G6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Q8N9G6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q8N9G6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q8N9G6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q8N9G6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q8N9G6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Q8N9G6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q8N9G6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q8N9G6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q8N9G6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q8N9G6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q8N9G6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q8N9G6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Q8N9G6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Q8N9G6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Q8N9G6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Q8N9G6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q8N9G6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q8N9G6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q8N9G6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q8N9G6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q8N9G6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q8N9G6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q8N9G6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q8N9G6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q8N9G6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q8N9G6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q8N9G6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q8N9G6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q8N9G6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q8N9G6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q8N9G6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q8N9G6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q8N9G6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q8N9G6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q8N9G6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q8N9G6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Q8N9G6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q8N9G6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q8N9G6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q8N9G6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q8N9G6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Q8N9G6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Q8N9G6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q8N9G6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q8N9G6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q8N9G6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q8N9G6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q8N9G6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Q8N9G6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Q8N9G6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Q8N9G6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Q8N9G6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q8N9G6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q8N9G6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q8N9G6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Q8N9G6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Q8N9G6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Q8N9G6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Q8N9G6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q8N9G6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms