Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M0

OTUD6B, OTU domain-containing protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6BQ8N6M0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
OTUD6BQ8N6M0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OTUD6BQ8N6M0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OTUD6BQ8N6M0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OTUD6BQ8N6M0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
OTUD6BQ8N6M0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
OTUD6BQ8N6M0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
OTUD6BQ8N6M0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
OTUD6BQ8N6M0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
OTUD6BQ8N6M0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
OTUD6BQ8N6M0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
OTUD6BQ8N6M0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
OTUD6BQ8N6M0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
OTUD6BQ8N6M0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
OTUD6BQ8N6M0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
OTUD6BQ8N6M0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
OTUD6BQ8N6M0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
OTUD6BQ8N6M0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
OTUD6BQ8N6M0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
OTUD6BQ8N6M0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
OTUD6BQ8N6M0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
OTUD6BQ8N6M0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
OTUD6BQ8N6M0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
OTUD6BQ8N6M0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
OTUD6BQ8N6M0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
OTUD6BQ8N6M0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
OTUD6BQ8N6M0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
OTUD6BQ8N6M0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
OTUD6BQ8N6M0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
OTUD6BQ8N6M0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
OTUD6BQ8N6M0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
OTUD6BQ8N6M0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
OTUD6BQ8N6M0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
OTUD6BQ8N6M0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
OTUD6BQ8N6M0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
OTUD6BQ8N6M0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
OTUD6BQ8N6M0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
OTUD6BQ8N6M0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
OTUD6BQ8N6M0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
OTUD6BQ8N6M0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
OTUD6BQ8N6M0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
OTUD6BQ8N6M0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
OTUD6BQ8N6M0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
OTUD6BQ8N6M0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
OTUD6BQ8N6M0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
OTUD6BQ8N6M0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
OTUD6BQ8N6M0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
OTUD6BQ8N6M0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
OTUD6BQ8N6M0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
OTUD6BQ8N6M0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
OTUD6BQ8N6M0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
OTUD6BQ8N6M0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
OTUD6BQ8N6M0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
OTUD6BQ8N6M0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
OTUD6BQ8N6M0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
OTUD6BQ8N6M0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
OTUD6BQ8N6M0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
OTUD6BQ8N6M0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
OTUD6BQ8N6M0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
OTUD6BQ8N6M0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
OTUD6BQ8N6M0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
OTUD6BQ8N6M0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
OTUD6BQ8N6M0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
OTUD6BQ8N6M0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
OTUD6BQ8N6M0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
OTUD6BQ8N6M0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
OTUD6BQ8N6M0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
OTUD6BQ8N6M0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
OTUD6BQ8N6M0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
OTUD6BQ8N6M0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
OTUD6BQ8N6M0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
OTUD6BQ8N6M0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
OTUD6BQ8N6M0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
OTUD6BQ8N6M0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
OTUD6BQ8N6M0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
OTUD6BQ8N6M0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
OTUD6BQ8N6M0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
OTUD6BQ8N6M0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
OTUD6BQ8N6M0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
OTUD6BQ8N6M0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
OTUD6BQ8N6M0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
OTUD6BQ8N6M0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
OTUD6BQ8N6M0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
OTUD6BQ8N6M0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
OTUD6BQ8N6M0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
OTUD6BQ8N6M0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
OTUD6BQ8N6M0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
OTUD6BQ8N6M0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
OTUD6BQ8N6M0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
OTUD6BQ8N6M0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
OTUD6BQ8N6M0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OTUD6BQ8N6M0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OTUD6BQ8N6M0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OTUD6BQ8N6M0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
OTUD6BQ8N6M0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
OTUD6BQ8N6M0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
OTUD6BQ8N6M0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTUD6BQ8N6M0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTUD6BQ8N6M0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTUD6BQ8N6M0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms