Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M0

OTUD6B, OTU domain-containing protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6BQ8N6M0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
OTUD6BQ8N6M0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
OTUD6BQ8N6M0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
OTUD6BQ8N6M0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
OTUD6BQ8N6M0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
OTUD6BQ8N6M0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
OTUD6BQ8N6M0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
OTUD6BQ8N6M0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
OTUD6BQ8N6M0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
OTUD6BQ8N6M0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
OTUD6BQ8N6M0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
OTUD6BQ8N6M0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
OTUD6BQ8N6M0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
OTUD6BQ8N6M0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
OTUD6BQ8N6M0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
OTUD6BQ8N6M0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
OTUD6BQ8N6M0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
OTUD6BQ8N6M0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
OTUD6BQ8N6M0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
OTUD6BQ8N6M0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
OTUD6BQ8N6M0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
OTUD6BQ8N6M0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
OTUD6BQ8N6M0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
OTUD6BQ8N6M0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
OTUD6BQ8N6M0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
OTUD6BQ8N6M0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
OTUD6BQ8N6M0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
OTUD6BQ8N6M0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
OTUD6BQ8N6M0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
OTUD6BQ8N6M0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
OTUD6BQ8N6M0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
OTUD6BQ8N6M0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
OTUD6BQ8N6M0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
OTUD6BQ8N6M0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
OTUD6BQ8N6M0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
OTUD6BQ8N6M0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
OTUD6BQ8N6M0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
OTUD6BQ8N6M0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
OTUD6BQ8N6M0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
OTUD6BQ8N6M0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
OTUD6BQ8N6M0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
OTUD6BQ8N6M0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
OTUD6BQ8N6M0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
OTUD6BQ8N6M0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
OTUD6BQ8N6M0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
OTUD6BQ8N6M0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
OTUD6BQ8N6M0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
OTUD6BQ8N6M0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
OTUD6BQ8N6M0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
OTUD6BQ8N6M0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
OTUD6BQ8N6M0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
OTUD6BQ8N6M0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
OTUD6BQ8N6M0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
OTUD6BQ8N6M0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
OTUD6BQ8N6M0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
OTUD6BQ8N6M0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
OTUD6BQ8N6M0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
OTUD6BQ8N6M0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
OTUD6BQ8N6M0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
OTUD6BQ8N6M0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
OTUD6BQ8N6M0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
OTUD6BQ8N6M0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
OTUD6BQ8N6M0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
OTUD6BQ8N6M0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
OTUD6BQ8N6M0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
OTUD6BQ8N6M0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
OTUD6BQ8N6M0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
OTUD6BQ8N6M0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
OTUD6BQ8N6M0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
OTUD6BQ8N6M0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
OTUD6BQ8N6M0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
OTUD6BQ8N6M0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
OTUD6BQ8N6M0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
OTUD6BQ8N6M0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
OTUD6BQ8N6M0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
OTUD6BQ8N6M0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
OTUD6BQ8N6M0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
OTUD6BQ8N6M0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
OTUD6BQ8N6M0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
OTUD6BQ8N6M0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
OTUD6BQ8N6M0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
OTUD6BQ8N6M0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
OTUD6BQ8N6M0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
OTUD6BQ8N6M0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
OTUD6BQ8N6M0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
OTUD6BQ8N6M0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
OTUD6BQ8N6M0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
OTUD6BQ8N6M0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
OTUD6BQ8N6M0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
OTUD6BQ8N6M0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
OTUD6BQ8N6M0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
OTUD6BQ8N6M0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
OTUD6BQ8N6M0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
OTUD6BQ8N6M0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
OTUD6BQ8N6M0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
OTUD6BQ8N6M0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
OTUD6BQ8N6M0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
OTUD6BQ8N6M0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
OTUD6BQ8N6M0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
OTUD6BQ8N6M0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms