Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC50Q8IVM0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC50Q8IVM0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC50Q8IVM0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC50Q8IVM0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC50Q8IVM0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC50Q8IVM0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC50Q8IVM0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC50Q8IVM0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC50Q8IVM0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC50Q8IVM0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC50Q8IVM0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC50Q8IVM0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC50Q8IVM0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC50Q8IVM0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC50Q8IVM0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
CCDC50Q8IVM0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC50Q8IVM0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC50Q8IVM0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC50Q8IVM0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC50Q8IVM0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC50Q8IVM0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC50Q8IVM0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC50Q8IVM0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC50Q8IVM0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC50Q8IVM0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC50Q8IVM0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC50Q8IVM0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC50Q8IVM0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC50Q8IVM0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC50Q8IVM0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC50Q8IVM0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC50Q8IVM0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC50Q8IVM0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC50Q8IVM0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC50Q8IVM0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC50Q8IVM0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC50Q8IVM0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC50Q8IVM0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC50Q8IVM0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC50Q8IVM0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC50Q8IVM0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC50Q8IVM0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC50Q8IVM0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC50Q8IVM0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC50Q8IVM0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC50Q8IVM0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC50Q8IVM0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC50Q8IVM0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC50Q8IVM0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC50Q8IVM0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC50Q8IVM0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC50Q8IVM0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC50Q8IVM0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC50Q8IVM0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC50Q8IVM0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC50Q8IVM0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC50Q8IVM0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC50Q8IVM0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC50Q8IVM0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC50Q8IVM0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC50Q8IVM0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC50Q8IVM0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC50Q8IVM0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC50Q8IVM0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC50Q8IVM0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC50Q8IVM0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC50Q8IVM0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC50Q8IVM0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC50Q8IVM0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC50Q8IVM0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC50Q8IVM0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC50Q8IVM0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC50Q8IVM0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC50Q8IVM0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC50Q8IVM0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC50Q8IVM0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC50Q8IVM0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC50Q8IVM0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC50Q8IVM0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC50Q8IVM0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC50Q8IVM0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC50Q8IVM0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC50Q8IVM0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC50Q8IVM0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC50Q8IVM0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC50Q8IVM0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC50Q8IVM0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC50Q8IVM0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC50Q8IVM0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC50Q8IVM0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC50Q8IVM0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC50Q8IVM0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms