Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUR0

TRAPPC5, Trafficking protein particle complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC5Q8IUR0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC5Q8IUR0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC5Q8IUR0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC5Q8IUR0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC5Q8IUR0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC5Q8IUR0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC5Q8IUR0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC5Q8IUR0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC5Q8IUR0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC5Q8IUR0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC5Q8IUR0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC5Q8IUR0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC5Q8IUR0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC5Q8IUR0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC5Q8IUR0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC5Q8IUR0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC5Q8IUR0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC5Q8IUR0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC5Q8IUR0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC5Q8IUR0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC5Q8IUR0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAPPC5Q8IUR0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC5Q8IUR0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC5Q8IUR0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC5Q8IUR0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC5Q8IUR0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC5Q8IUR0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC5Q8IUR0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC5Q8IUR0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC5Q8IUR0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC5Q8IUR0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC5Q8IUR0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC5Q8IUR0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAPPC5Q8IUR0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC5Q8IUR0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC5Q8IUR0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC5Q8IUR0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC5Q8IUR0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC5Q8IUR0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC5Q8IUR0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC5Q8IUR0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC5Q8IUR0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC5Q8IUR0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC5Q8IUR0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC5Q8IUR0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC5Q8IUR0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC5Q8IUR0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC5Q8IUR0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC5Q8IUR0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC5Q8IUR0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC5Q8IUR0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC5Q8IUR0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC5Q8IUR0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC5Q8IUR0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC5Q8IUR0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC5Q8IUR0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC5Q8IUR0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC5Q8IUR0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC5Q8IUR0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC5Q8IUR0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC5Q8IUR0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC5Q8IUR0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRAPPC5Q8IUR0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC5Q8IUR0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC5Q8IUR0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC5Q8IUR0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC5Q8IUR0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC5Q8IUR0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC5Q8IUR0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC5Q8IUR0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC5Q8IUR0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC5Q8IUR0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC5Q8IUR0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC5Q8IUR0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC5Q8IUR0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC5Q8IUR0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC5Q8IUR0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC5Q8IUR0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC5Q8IUR0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAPPC5Q8IUR0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC5Q8IUR0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC5Q8IUR0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC5Q8IUR0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC5Q8IUR0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC5Q8IUR0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC5Q8IUR0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC5Q8IUR0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC5Q8IUR0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC5Q8IUR0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC5Q8IUR0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC5Q8IUR0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC5Q8IUR0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC5Q8IUR0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC5Q8IUR0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC5Q8IUR0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC5Q8IUR0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC5Q8IUR0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC5Q8IUR0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC5Q8IUR0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC5Q8IUR0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms