Protein–RNA interactions for Protein: Q86VW1

SLC22A16, Solute carrier family 22 member 16, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A16Q86VW1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC22A16Q86VW1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC22A16Q86VW1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC22A16Q86VW1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC22A16Q86VW1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC22A16Q86VW1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC22A16Q86VW1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC22A16Q86VW1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC22A16Q86VW1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC22A16Q86VW1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC22A16Q86VW1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC22A16Q86VW1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC22A16Q86VW1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC22A16Q86VW1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC22A16Q86VW1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC22A16Q86VW1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC22A16Q86VW1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC22A16Q86VW1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC22A16Q86VW1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC22A16Q86VW1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC22A16Q86VW1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC22A16Q86VW1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC22A16Q86VW1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC22A16Q86VW1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC22A16Q86VW1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC22A16Q86VW1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC22A16Q86VW1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC22A16Q86VW1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC22A16Q86VW1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC22A16Q86VW1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC22A16Q86VW1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC22A16Q86VW1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC22A16Q86VW1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC22A16Q86VW1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC22A16Q86VW1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC22A16Q86VW1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC22A16Q86VW1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC22A16Q86VW1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC22A16Q86VW1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC22A16Q86VW1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC22A16Q86VW1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC22A16Q86VW1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC22A16Q86VW1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC22A16Q86VW1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC22A16Q86VW1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC22A16Q86VW1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC22A16Q86VW1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC22A16Q86VW1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC22A16Q86VW1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC22A16Q86VW1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC22A16Q86VW1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC22A16Q86VW1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC22A16Q86VW1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC22A16Q86VW1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC22A16Q86VW1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC22A16Q86VW1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC22A16Q86VW1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC22A16Q86VW1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC22A16Q86VW1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC22A16Q86VW1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC22A16Q86VW1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC22A16Q86VW1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC22A16Q86VW1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC22A16Q86VW1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC22A16Q86VW1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC22A16Q86VW1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC22A16Q86VW1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC22A16Q86VW1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC22A16Q86VW1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC22A16Q86VW1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC22A16Q86VW1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC22A16Q86VW1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC22A16Q86VW1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC22A16Q86VW1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC22A16Q86VW1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC22A16Q86VW1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC22A16Q86VW1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC22A16Q86VW1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC22A16Q86VW1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC22A16Q86VW1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC22A16Q86VW1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC22A16Q86VW1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC22A16Q86VW1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC22A16Q86VW1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC22A16Q86VW1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC22A16Q86VW1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC22A16Q86VW1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC22A16Q86VW1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC22A16Q86VW1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC22A16Q86VW1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC22A16Q86VW1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC22A16Q86VW1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC22A16Q86VW1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC22A16Q86VW1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC22A16Q86VW1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC22A16Q86VW1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC22A16Q86VW1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC22A16Q86VW1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC22A16Q86VW1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC22A16Q86VW1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms