Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.326e-10■■■■■ 42.6
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SND1Q7KZF4 GRN-202ENST00000585348 600 ntTSL 212.18□□□□□ -0.462e-12■■■■■ 42.4
SND1Q7KZF4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.481e-8■■■■■ 42.2
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SND1Q7KZF4 CLDN4-202ENST00000431918 4108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.411e-8■■■■■ 42.2
SND1Q7KZF4 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.81e-323■■■■■ 42.2
SND1Q7KZF4 PRKCSH-210ENST00000589990 567 ntTSL 213.25□□□□□ -0.296e-16■■■■■ 42.1
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SND1Q7KZF4 TTR-204ENST00000610404 1040 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.961e-11■■■■■ 41.8
SND1Q7KZF4 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.211e-11■■■■■ 41.8
SND1Q7KZF4 IDI1-205ENST00000491735 1066 ntTSL 1 (best)20.82■□□□□ 0.922e-16■■■■■ 41.8
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SND1Q7KZF4 TTR-202ENST00000432547 745 ntTSL 28.29□□□□□ -1.084e-11■■■■■ 41.8
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SND1Q7KZF4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.151e-323■■■■■ 41.7
SND1Q7KZF4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.121e-323■■■■■ 41.7
SND1Q7KZF4 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.151e-323■■■■■ 41.7
SND1Q7KZF4 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.151e-323■■■■■ 41.7
SND1Q7KZF4 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.013e-13■■■■■ 41.6
SND1Q7KZF4 CX3CL1-201ENST00000006053 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.533e-13■■■■■ 41.6
SND1Q7KZF4 CX3CL1-202ENST00000563383 3313 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.563e-13■■■■■ 41.6
SND1Q7KZF4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.182e-11■■■■■ 41.5
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SND1Q7KZF4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.472e-11■■■■■ 41.5
SND1Q7KZF4 GALNT7-206ENST00000512285 1567 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.682e-11■■■■■ 41.5
SND1Q7KZF4 YIPF4-201ENST00000238831 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.872e-11■■■■■ 41.5
SND1Q7KZF4 YIPF4-202ENST00000437765 728 ntTSL 58.82□□□□□ -12e-11■■■■■ 41.5
SND1Q7KZF4 YIPF4-203ENST00000441084 312 ntTSL 36.39□□□□□ -1.392e-11■■■■■ 41.5
SND1Q7KZF4 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.094e-7■■■■■ 41.4
SND1Q7KZF4 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.084e-7■■■■■ 41.4
SND1Q7KZF4 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.714e-7■■■■■ 41.4
SND1Q7KZF4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.43e-11■■■■■ 41.4
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SND1Q7KZF4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 13e-11■■■■■ 41.4
SND1Q7KZF4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.813e-11■■■■■ 41.4
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SND1Q7KZF4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.514e-7■■■■■ 41.4
SND1Q7KZF4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.53e-11■■■■■ 41.4
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SND1Q7KZF4 SLC12A9-212ENST00000482184 656 ntTSL 313.65□□□□□ -0.224e-7■■■■■ 41.4
SND1Q7KZF4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.396e-10■■■■■ 41.3
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SND1Q7KZF4 CTSC-201ENST00000227266 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 40.2
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SND1Q7KZF4 PTMA-208ENST00000448874 1108 ntTSL 217.15■□□□□ 0.347e-11■■■■■ 40.2
SND1Q7KZF4 PTMA-210ENST00000467816 378 ntTSL 214.08□□□□□ -0.167e-11■■■■■ 40.2
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SND1Q7KZF4 PTMA-209ENST00000466801 784 ntTSL 511.42□□□□□ -0.587e-11■■■■■ 40.2
SND1Q7KZF4 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.587e-11■■■■■ 40.2
SND1Q7KZF4 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.637e-11■■■■■ 40.2
SND1Q7KZF4 PTMA-203ENST00000409321 735 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.687e-11■■■■■ 40.2
SND1Q7KZF4 PTMA-201ENST00000341369 1212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.757e-11■■■■■ 40.2
SND1Q7KZF4 PLOD3-213ENST00000478264 663 ntTSL 218.93■□□□□ 0.623e-11■■■■■ 40.1
SND1Q7KZF4 GHDC-208ENST00000588352 559 ntTSL 517.7■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 40.1
SND1Q7KZF4 VWA1-202ENST00000471398 458 ntTSL 318.29■□□□□ 0.522e-9■■■■■ 40
SND1Q7KZF4 HPX-202ENST00000525057 760 ntTSL 511.33□□□□□ -0.69e-8■■■■■ 40
SND1Q7KZF4 FKBP2-205ENST00000536642 637 ntTSL 219.86■□□□□ 0.779e-9■■■■■ 40
SND1Q7KZF4 P4HA2-218ENST00000474628 743 ntTSL 28.08□□□□□ -1.121e-9■■■■■ 40
SND1Q7KZF4 C5orf15-201ENST00000231512 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.131e-10■■■■■ 39.9
SND1Q7KZF4 C5orf15-202ENST00000507191 635 ntTSL 212.11□□□□□ -0.471e-10■■■■■ 39.9
SND1Q7KZF4 PLOD3-216ENST00000489927 562 ntTSL 216.4■□□□□ 0.228e-15■■■■■ 39.9
SND1Q7KZF4 TFRC-214ENST00000483983 757 ntTSL 28.94□□□□□ -0.986e-12■■■■■ 39.9
SND1Q7KZF4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.574e-10■■■■■ 39.8
SND1Q7KZF4 CTSL-206ENST00000495822 988 ntTSL 1 (best)15.35■□□□□ 0.054e-10■■■■■ 39.8
SND1Q7KZF4 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.054e-10■■■■■ 39.8
SND1Q7KZF4 CTSL-204ENST00000375894 975 ntTSL 314.12□□□□□ -0.154e-10■■■■■ 39.8
SND1Q7KZF4 BGN-204ENST00000480756 2278 ntTSL 515.11■□□□□ 0.012e-8■■■■■ 39.8
SND1Q7KZF4 BGN-203ENST00000472615 2225 ntTSL 513.56□□□□□ -0.242e-8■■■■■ 39.8
SND1Q7KZF4 BGN-201ENST00000331595 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.252e-8■■■■■ 39.8
SND1Q7KZF4 BGN-205ENST00000492658 420 ntTSL 310.39□□□□□ -0.752e-8■■■■■ 39.8
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